44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1049 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  36.86 
 
 
1805 aa  710    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  35.14 
 
 
2159 aa  713    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  100 
 
 
1460 aa  2893    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  31.22 
 
 
1921 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  32.99 
 
 
1878 aa  539  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  34.53 
 
 
1831 aa  523  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  32.86 
 
 
1937 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  31.86 
 
 
933 aa  207  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  26.99 
 
 
487 aa  89.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  24.7 
 
 
1268 aa  66.6  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
937 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  25.78 
 
 
876 aa  60.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  25.78 
 
 
876 aa  60.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  33.33 
 
 
659 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
811 aa  59.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  27.91 
 
 
459 aa  56.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  31.91 
 
 
589 aa  54.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  22.51 
 
 
909 aa  54.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
916 aa  54.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.19 
 
 
532 aa  53.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
1054 aa  52.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  26.36 
 
 
457 aa  52.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
846 aa  51.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  30.98 
 
 
1476 aa  51.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
1025 aa  51.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3055  hypothetical protein  30.26 
 
 
615 aa  50.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1972  hypothetical protein  30.56 
 
 
487 aa  48.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.75 
 
 
968 aa  48.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.43 
 
 
991 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  27.21 
 
 
937 aa  48.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  22.02 
 
 
432 aa  47.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  32.76 
 
 
338 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1925  hypothetical protein  29.44 
 
 
783 aa  47  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
880 aa  46.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.68 
 
 
943 aa  47  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
868 aa  47  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  25.49 
 
 
884 aa  46.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
1162 aa  46.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  40.58 
 
 
303 aa  46.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.91 
 
 
1162 aa  46.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  20.85 
 
 
1060 aa  46.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  29.17 
 
 
883 aa  46.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 
2741 aa  45.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 
1114 aa  45.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>