48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3618 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1878 aa  720    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  100 
 
 		 1805 aa  3650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  32.04 
 
 		 1921 aa  756    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  38.21 
 
 		 2159 aa  998    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  36.12 
 
 		 1460 aa  692    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1831 aa  602  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1937 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  32.68 
 
 		 933 aa  302  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 851 aa  71.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.06 
 
 		 2741 aa  67.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.31 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 2741 aa  65.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1268 aa  65.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 937 aa  63.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  23.83 
 
 		 979 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  30.73 
 
 		 487 aa  58.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 916 aa  57.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.62 
 
 		 968 aa  57  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  29.11 
 
 		 459 aa  57.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 846 aa  57  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1025 aa  55.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.55 
 
 		 1162 aa  55.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1162 aa  55.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  26.22 
 
 		 883 aa  55.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  28.95 
 
 		 659 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3055  hypothetical protein  23.44 
 
 		 615 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1142 aa  54.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1060 aa  53.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 854 aa  53.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  30.26 
 
 		 468 aa  52.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  27.5 
 
 		 876 aa  52  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  27.5 
 
 		 876 aa  52  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 1363 aa  51.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  23.13 
 
 		 903 aa  50.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.66 
 
 		 991 aa  50.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  27.49 
 
 		 950 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1024 aa  48.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  23.91 
 
 		 782 aa  48.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  28.14 
 
 		 1429 aa  48.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  23.77 
 
 		 569 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  31.03 
 
 		 1009 aa  48.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  27.49 
 
 		 950 aa  48.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 868 aa  47.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.4 
 
 		 1611 aa  47  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1192 aa  46.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1096 aa  46.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1051 aa  45.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 796 aa  45.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>