35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1130 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  955    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  24.34 
 
 
876 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  24.34 
 
 
876 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  26.96 
 
 
459 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  29.35 
 
 
1805 aa  56.6  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  24.8 
 
 
414 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  25.06 
 
 
2159 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  47.06 
 
 
342 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  30.28 
 
 
211 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  29.74 
 
 
1937 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  35.44 
 
 
225 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  37.93 
 
 
589 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  36.84 
 
 
197 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  27.69 
 
 
457 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.41 
 
 
286 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  30 
 
 
309 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  34.62 
 
 
293 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  34.25 
 
 
222 aa  47  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  34.12 
 
 
197 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  35.06 
 
 
203 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  44.44 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  48.65 
 
 
339 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  41.86 
 
 
298 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1661  PGAP1 family protein  34.15 
 
 
312 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.403655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  26.23 
 
 
222 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  31.19 
 
 
192 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  29.1 
 
 
1460 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0290  hypothetical protein  26.11 
 
 
685 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1108  hypothetical protein  32.32 
 
 
293 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0281  hypothetical protein  21.97 
 
 
432 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  42.03 
 
 
287 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  33.77 
 
 
203 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  51.16 
 
 
287 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  51.16 
 
 
287 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  43.59 
 
 
356 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>