20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3055 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3055  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1253    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1925  hypothetical protein  25.89 
 
 
783 aa  87.4  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  24.58 
 
 
1268 aa  74.7  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  26.09 
 
 
659 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  23.44 
 
 
1805 aa  54.3  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  26.47 
 
 
1937 aa  52  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  25.35 
 
 
840 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  30.26 
 
 
1460 aa  50.8  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  25.32 
 
 
893 aa  50.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  28.04 
 
 
1051 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.49 
 
 
809 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 
854 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3451  hypothetical protein  35.06 
 
 
710 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.975495  normal  0.147632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  29.85 
 
 
1878 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  29.14 
 
 
2159 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  22.99 
 
 
950 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  28.97 
 
 
827 aa  44.3  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  26.32 
 
 
909 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  23.66 
 
 
1831 aa  44.3  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  22.99 
 
 
950 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>