134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7004 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  100 
 
 		 1051 aa  2097    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  34.25 
 
 		 565 aa  187  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  36.31 
 
 		 521 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1096 aa  161  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1142 aa  152  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1058 aa  142  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1104 aa  138  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  33.42 
 
 		 827 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  24.77 
 
 		 852 aa  128  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.8 
 
 		 1007 aa  125  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 1247 aa  124  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 994 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1077 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  24.05 
 
 		 1476 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 1779 aa  122  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 1711 aa  121  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  24.63 
 
 		 997 aa  114  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  24.25 
 
 		 1363 aa  114  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1171 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  25.49 
 
 		 1219 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 1276 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1076 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1441 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  24.06 
 
 		 992 aa  106  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 1276 aa  104  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  26.25 
 
 		 1114 aa  99  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  30.02 
 
 		 1228 aa  95.5  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1127 aa  93.2  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.63 
 
 		 2741 aa  92  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.61 
 
 		 2741 aa  92  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  28.8 
 
 		 717 aa  90.5  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1241 aa  88.2  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1192 aa  82.8  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1147 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.38 
 
 		 532 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  27.78 
 
 		 909 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 1162 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1162 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 868 aa  79.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 846 aa  77.8  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.57 
 
 		 3299 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1060 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 729 aa  76.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 991 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  30.53 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 1448 aa  75.5  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 916 aa  75.5  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  26.05 
 
 		 1009 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.27 
 
 		 809 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  23.62 
 
 		 950 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  23.62 
 
 		 950 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  29.72 
 
 		 903 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.45 
 
 		 828 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.24 
 
 		 3537 aa  71.6  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.48 
 
 		 1772 aa  71.2  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1266 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  37.68 
 
 		 874 aa  70.5  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 885 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.87 
 
 		 3535 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.87 
 
 		 3419 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1247 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 		 747 aa  69.7  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.87 
 
 		 3298 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 883 aa  69.3  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  24.54 
 
 		 853 aa  69.3  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.09 
 
 		 1186 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  23.55 
 
 		 884 aa  68.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 868 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 928 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 854 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.36 
 
 		 919 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  23.5 
 
 		 1328 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  29.36 
 
 		 418 aa  66.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 1215 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1055 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 1544 aa  65.1  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 851 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 		 854 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  34.83 
 
 		 447 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 1025 aa  63.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  27.87 
 
 		 944 aa  63.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.14 
 
 		 2637 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 		 1054 aa  62.4  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1621 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.87 
 
 		 1650 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  34.75 
 
 		 893 aa  60.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  26.13 
 
 		 192 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  29.17 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  22.99 
 
 		 698 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  26.73 
 
 		 840 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 949 aa  58.2  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 851 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  32.28 
 
 		 595 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  32.82 
 
 		 751 aa  55.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1024 aa  55.5  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  22.63 
 
 		 845 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 880 aa  54.7  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 905 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  30 
 
 		 989 aa  54.3  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  28.35 
 
 		 877 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>