32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1230 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  31.95 
 
 		 1805 aa  646    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  33.32 
 
 		 2159 aa  765    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  100 
 
 		 1831 aa  3659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  43.81 
 
 		 933 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1878 aa  591  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  34.74 
 
 		 1460 aa  535  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1921 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1937 aa  404  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  28.16 
 
 		 487 aa  95.5  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  48.05 
 
 		 589 aa  61.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1268 aa  59.3  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1025 aa  58.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1636  hypothetical protein  26.15 
 
 		 442 aa  53.5  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  31.58 
 
 		 1611 aa  53.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 1055 aa  53.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.78 
 
 		 532 aa  51.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  27.01 
 
 		 459 aa  51.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0840  PGAP1 family protein  28.19 
 
 		 414 aa  50.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00684645  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 916 aa  50.1  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 1162 aa  49.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  32.58 
 
 		 848 aa  49.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.41 
 
 		 854 aa  49.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 		 1162 aa  49.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  27.27 
 
 		 659 aa  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  24.68 
 
 		 937 aa  47.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  34.73 
 
 		 457 aa  47.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  28.93 
 
 		 876 aa  47  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  28.93 
 
 		 876 aa  47  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1596 aa  46.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4676  hypothetical protein  25.96 
 
 		 471 aa  46.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1714 aa  46.2  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  25.84 
 
 		 468 aa  45.8  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>