39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3255 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  61.76 
 
 
562 aa  683    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  100 
 
 
569 aa  1172    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  61.76 
 
 
562 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  51.93 
 
 
559 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  49.82 
 
 
525 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  49.19 
 
 
544 aa  507  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  34.02 
 
 
835 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  32.33 
 
 
823 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  31.11 
 
 
806 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.18 
 
 
943 aa  84.7  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  27.73 
 
 
697 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  28.27 
 
 
689 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5312  Appr-1-p processing domain protein  24.23 
 
 
694 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  24.86 
 
 
1203 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1958 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
1313 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  24.11 
 
 
496 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.17 
 
 
1238 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  26.76 
 
 
782 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  22.42 
 
 
467 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 
813 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  28.66 
 
 
1073 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  22.66 
 
 
699 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
1714 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0053  hypothetical protein  25.98 
 
 
750 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0689055  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  23.93 
 
 
1689 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  28.85 
 
 
1914 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  25.32 
 
 
1611 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  28.07 
 
 
689 aa  50.4  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5318  hypothetical protein  26.79 
 
 
550 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120389  normal  0.353542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
1285 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 
1101 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1986  hypothetical protein  31.96 
 
 
682 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  23.77 
 
 
1805 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  23.05 
 
 
1921 aa  47  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 
705 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  26.85 
 
 
1020 aa  45.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 
1063 aa  44.3  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  25.32 
 
 
489 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>