More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2131 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
813 aa  1664    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  49.76 
 
 
471 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1298  Extracellular ligand-binding receptor  48.11 
 
 
471 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1267  Extracellular ligand-binding receptor  48.11 
 
 
471 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  51.97 
 
 
782 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5312  Appr-1-p processing domain protein  47.92 
 
 
694 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4967  Extracellular ligand-binding receptor  41.37 
 
 
468 aa  321  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  47.08 
 
 
1073 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5318  hypothetical protein  39.74 
 
 
550 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120389  normal  0.353542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
791 aa  220  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 
795 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 
795 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0941  serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 
758 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5172  Extracellular ligand-binding receptor  34.99 
 
 
547 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1828  extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 
512 aa  174  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0944  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.83 
 
 
529 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.910902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0917  hydrophobic amino acid uptake ABC-transporter  32.58 
 
 
529 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2791  Serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 
780 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0818409  normal  0.914958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 
1007 aa  160  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2769  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 
981 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0053  hypothetical protein  31.31 
 
 
750 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0689055  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
380 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  28.47 
 
 
419 aa  84  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 
376 aa  84  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
377 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0942  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
576 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  27.65 
 
 
806 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.68 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  24.7 
 
 
383 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 
371 aa  73.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 
386 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2773  Extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 
372 aa  72  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.89 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 
374 aa  70.1  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1842  extracellular ligand-binding receptor  25.16 
 
 
394 aa  69.7  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843132  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  23.99 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.13 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2232  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  25.56 
 
 
835 aa  68.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0110  Extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 
381 aa  67.4  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 
383 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 
370 aa  67  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
386 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
599 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
376 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 
383 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.16 
 
 
399 aa  65.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 
382 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 
372 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
383 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 
369 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.12 
 
 
396 aa  64.3  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0065  Extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 
392 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  25.44 
 
 
376 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  24.03 
 
 
384 aa  64.3  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 
404 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  23.3 
 
 
386 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  23.51 
 
 
544 aa  63.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 
381 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
382 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  25.84 
 
 
397 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  25.84 
 
 
397 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  24.35 
 
 
373 aa  62.4  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.83 
 
 
404 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 
404 aa  62.4  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  22.05 
 
 
401 aa  62.4  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.47 
 
 
397 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1935  Extracellular ligand-binding receptor  41 
 
 
375 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  24.62 
 
 
569 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.88 
 
 
395 aa  61.2  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 
388 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  26.36 
 
 
371 aa  61.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0714  Extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 
395 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4810  extracellular ligand-binding receptor  24.63 
 
 
422 aa  60.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  23.26 
 
 
375 aa  60.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0326  extracellular ligand-binding receptor  42.42 
 
 
362 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169936  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  24.19 
 
 
823 aa  60.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  26.73 
 
 
380 aa  60.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
393 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 
388 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  23.62 
 
 
525 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.05 
 
 
401 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5073  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  21.15 
 
 
599 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  24.41 
 
 
384 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  22.36 
 
 
401 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.46 
 
 
380 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.6 
 
 
376 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.46 
 
 
380 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.46 
 
 
380 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  37.36 
 
 
413 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.62 
 
 
380 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  37.36 
 
 
374 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
643 aa  59.3  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>