39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3262 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  100 
 
 		 1020 aa  2053    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  27.44 
 
 		 979 aa  169  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  29 
 
 		 1429 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  30.73 
 
 		 489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  30.43 
 
 		 1611 aa  103  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1526 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 1714 aa  79.7  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 1101 aa  78.2  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 1063 aa  77  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  32.39 
 
 		 848 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  29.88 
 
 		 1914 aa  67.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1238 aa  62.4  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  23.36 
 
 		 835 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 1450 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  35.48 
 
 		 689 aa  55.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1298 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1921 aa  54.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3868  Tetratricopeptide TPR_4  24.2 
 
 		 1736 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0314468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 776 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.12 
 
 		 943 aa  50.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 1313 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1689 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 1596 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  25.93 
 
 		 697 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  26.45 
 
 		 440 aa  48.5  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  26.35 
 
 		 559 aa  48.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 1958 aa  48.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.92 
 
 		 945 aa  48.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  37.29 
 
 		 814 aa  48.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  30.52 
 
 		 933 aa  47.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 916 aa  47  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1636  hypothetical protein  20.93 
 
 		 442 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  30.93 
 
 		 828 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  30.72 
 
 		 910 aa  46.2  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 796 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  26.85 
 
 		 569 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  27.27 
 
 		 944 aa  44.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 684 aa  44.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>