43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3525 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  100 
 
 
835 aa  1707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  63.96 
 
 
823 aa  1040    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  38.45 
 
 
806 aa  532  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  34.02 
 
 
569 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  34.29 
 
 
562 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  34.29 
 
 
562 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  31.32 
 
 
559 aa  157  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  32 
 
 
525 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4218  heterocyst differentiation protein  32.04 
 
 
303 aa  135  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  30.57 
 
 
544 aa  134  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.42 
 
 
943 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  26.14 
 
 
697 aa  101  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  27.33 
 
 
689 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.54 
 
 
1238 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  25.38 
 
 
496 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
1958 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  24.91 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  26.33 
 
 
1689 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  24.38 
 
 
699 aa  79  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  25.7 
 
 
1203 aa  72  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  21.7 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 
813 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  24.23 
 
 
534 aa  64.3  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 
1313 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
1285 aa  62.4  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  26.42 
 
 
1914 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
1714 aa  62  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5312  Appr-1-p processing domain protein  24.3 
 
 
694 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  23.36 
 
 
1020 aa  58.9  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  25.46 
 
 
699 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  24.29 
 
 
1073 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
1526 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  22.9 
 
 
979 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  26.46 
 
 
502 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  25.27 
 
 
440 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  22.58 
 
 
1611 aa  50.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  20.47 
 
 
504 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5318  hypothetical protein  22.43 
 
 
550 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120389  normal  0.353542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  27.27 
 
 
782 aa  47.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3868  Tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 
1736 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0314468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  19.23 
 
 
1921 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
928 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 
1298 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>