19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3868 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3868  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 1736 aa  3443    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0314468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 1526 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  29.67 
 
 		 1611 aa  130  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1238 aa  99  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  27.04 
 
 		 562 aa  65.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  27.04 
 
 		 562 aa  65.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  32.7 
 
 		 1429 aa  63.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 		 1101 aa  59.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  27.39 
 
 		 496 aa  55.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1298 aa  55.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1285 aa  54.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  27.12 
 
 		 1203 aa  54.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  21.07 
 
 		 1063 aa  53.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  33.61 
 
 		 534 aa  52.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1020 aa  52  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  34.71 
 
 		 684 aa  51.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.65 
 
 		 943 aa  51.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  27.52 
 
 		 532 aa  47  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  25 
 
 		 835 aa  47  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>