25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5578 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  1032    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1319  hypothetical protein  39.88 
 
 
521 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  35.58 
 
 
537 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  32.47 
 
 
504 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0984  hypothetical protein  32.1 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  29.14 
 
 
534 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2010  hypothetical protein  31.15 
 
 
528 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  29.38 
 
 
383 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  24.81 
 
 
467 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2661  hypothetical protein  26.09 
 
 
361 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2348  hypothetical protein  29.87 
 
 
254 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389344  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.87 
 
 
1238 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  26.26 
 
 
661 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.88 
 
 
943 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  29.14 
 
 
1689 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  26.46 
 
 
835 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
1063 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5261  hypothetical protein  31.43 
 
 
690 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165104  hitchhiker  0.00234042 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
1313 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  23.73 
 
 
496 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
1958 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  26.86 
 
 
440 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0620  hypothetical protein  27.93 
 
 
340 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0592031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  31.97 
 
 
1020 aa  43.5  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1636  hypothetical protein  30.43 
 
 
442 aa  43.5  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>