25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0984 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0984  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  861    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  44.78 
 
 		 537 aa  183  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  43.58 
 
 		 534 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  38.12 
 
 		 504 aa  152  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  30.77 
 
 		 661 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2661  hypothetical protein  27.75 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  30.73 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  32.1 
 
 		 502 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1319  hypothetical protein  28.98 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2348  hypothetical protein  32.6 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389344  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2010  hypothetical protein  29.89 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501978 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 1596 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3260  hypothetical protein  21.85 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5261  hypothetical protein  35.11 
 
 		 690 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165104  hitchhiker  0.00234042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.71 
 
 		 943 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  26.67 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  36.75 
 
 		 848 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1238 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1689 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 1958 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  22.81 
 
 		 534 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 1285 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1063 aa  46.6  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  31.62 
 
 		 1914 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1313 aa  43.5  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>