26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3126 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  766    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2348  hypothetical protein  52.78 
 
 		 254 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389344  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2010  hypothetical protein  50.56 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  34.78 
 
 		 534 aa  93.6  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  34.73 
 
 		 504 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0984  hypothetical protein  30.73 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2661  hypothetical protein  31.58 
 
 		 361 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  29.83 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  29.76 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  25.14 
 
 		 661 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.17 
 
 		 943 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  29.38 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  28.48 
 
 		 467 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  33.07 
 
 		 1104 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1319  hypothetical protein  27.01 
 
 		 521 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1238 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  30.71 
 
 		 697 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  31.03 
 
 		 689 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  27.37 
 
 		 1611 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 1450 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  37.96 
 
 		 848 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1986  hypothetical protein  26.76 
 
 		 682 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 1063 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1101 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  31.58 
 
 		 1914 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 1313 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>