22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1319 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1319  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1070    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  39.88 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  28.44 
 
 		 661 aa  73.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  27.67 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0984  hypothetical protein  28.98 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2661  hypothetical protein  29.38 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  29.74 
 
 		 504 aa  67  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.91 
 
 		 943 aa  67  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  28.18 
 
 		 534 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.52 
 
 		 1611 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  24.78 
 
 		 496 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 1063 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2010  hypothetical protein  28.41 
 
 		 528 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5261  hypothetical protein  29.29 
 
 		 690 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165104  hitchhiker  0.00234042 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 1313 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  27.01 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1689 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2348  hypothetical protein  28.98 
 
 		 254 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389344  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1238 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  23.98 
 
 		 845 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1526 aa  43.5  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 705 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>