20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2348 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389344  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2010  hypothetical protein  77.64 
 
 		 528 aa  371  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  52.78 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  28.57 
 
 		 504 aa  79  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  28.89 
 
 		 537 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0984  hypothetical protein  32.6 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.53 
 
 		 943 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  28.73 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  26.92 
 
 		 661 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  30.3 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1238 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  27.84 
 
 		 1611 aa  55.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  29.87 
 
 		 502 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1319  hypothetical protein  28.98 
 
 		 521 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  29.29 
 
 		 697 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  28.85 
 
 		 440 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  27.27 
 
 		 699 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  27.8 
 
 		 1429 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2661  hypothetical protein  24.6 
 
 		 361 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1725  FHA domain containing protein  31.25 
 
 		 781 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.184636  normal  0.609849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>