27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1725 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1725  FHA domain containing protein  100 
 
 
781 aa  1590    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.184636  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  29.41 
 
 
697 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 
304 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  28.68 
 
 
689 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.82 
 
 
943 aa  52  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  29.28 
 
 
302 aa  52  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
594 aa  52  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.15 
 
 
595 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 
317 aa  50.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  26.32 
 
 
1392 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  32.56 
 
 
607 aa  48.5  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.92 
 
 
598 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 
312 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  25.1 
 
 
306 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  26.85 
 
 
306 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  22.82 
 
 
320 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.36 
 
 
289 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  28.57 
 
 
553 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  25.56 
 
 
313 aa  45.8  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.27 
 
 
1238 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  29.55 
 
 
411 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  23.53 
 
 
299 aa  45.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  31.19 
 
 
471 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.77 
 
 
634 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28 
 
 
629 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  28.45 
 
 
468 aa  44.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  28.67 
 
 
496 aa  44.3  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>