183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4719 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
312 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  49.71 
 
 
588 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.41 
 
 
631 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  52.69 
 
 
553 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  51.18 
 
 
622 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  51.18 
 
 
622 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  51.65 
 
 
634 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  50.3 
 
 
642 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  44.27 
 
 
667 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  45.69 
 
 
658 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  47.02 
 
 
648 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  47.31 
 
 
647 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  42.03 
 
 
647 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  47.95 
 
 
723 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.68 
 
 
629 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  46.39 
 
 
647 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  45.18 
 
 
652 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  44.94 
 
 
598 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  43.41 
 
 
664 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  41.5 
 
 
317 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  45.03 
 
 
595 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.69 
 
 
624 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.69 
 
 
738 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  42.42 
 
 
603 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  43.6 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.41 
 
 
568 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.2 
 
 
568 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  42.26 
 
 
626 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  37.91 
 
 
310 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  38.79 
 
 
581 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  46.79 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  40.12 
 
 
597 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.35 
 
 
643 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  47.33 
 
 
150 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
596 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  38.79 
 
 
408 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  31.55 
 
 
594 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  32.84 
 
 
607 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  34.85 
 
 
680 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  28.82 
 
 
1392 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 
449 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 
449 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 
449 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 
468 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 
468 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
612 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  31.54 
 
 
304 aa  58.9  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  40.91 
 
 
657 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  26.11 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  25.43 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  33.64 
 
 
471 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  26.9 
 
 
1148 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.56 
 
 
577 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  30.08 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 
536 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  30.68 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  47.73 
 
 
654 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  34.81 
 
 
379 aa  53.9  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.09 
 
 
1151 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.09 
 
 
1151 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  35.04 
 
 
665 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  41.18 
 
 
616 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0397  putative adenylate/guanylate cyclase  28.14 
 
 
357 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850504  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.93 
 
 
1149 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  26.6 
 
 
1198 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 
216 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  56.25 
 
 
477 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  26.44 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  23.78 
 
 
308 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  26.34 
 
 
515 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  33.33 
 
 
462 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.33 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  25.54 
 
 
1130 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  23.32 
 
 
1093 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  46.34 
 
 
413 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
1142 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  25.77 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
1133 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.59 
 
 
465 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  25.81 
 
 
479 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  31.88 
 
 
472 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  25.91 
 
 
633 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  25.81 
 
 
518 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 
435 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 
380 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  22.71 
 
 
308 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  48.72 
 
 
486 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  26.84 
 
 
462 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  22.49 
 
 
1037 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 
348 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.65 
 
 
371 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1725  FHA domain containing protein  26.79 
 
 
781 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.184636  normal  0.609849 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>