More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3056 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
310 aa  621  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.38 
 
 
588 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  51.15 
 
 
647 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  50.59 
 
 
652 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  50.29 
 
 
568 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  50 
 
 
642 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  47.02 
 
 
648 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.37 
 
 
629 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  46.75 
 
 
723 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  46.2 
 
 
622 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  47.67 
 
 
647 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  46.2 
 
 
622 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  49.71 
 
 
647 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  43.01 
 
 
595 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  48.8 
 
 
658 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  44.51 
 
 
738 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  46.2 
 
 
624 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  46.06 
 
 
598 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  46.78 
 
 
568 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  45.29 
 
 
667 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.01 
 
 
631 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  41.67 
 
 
603 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  47.93 
 
 
553 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  43.71 
 
 
664 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.61 
 
 
634 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  44.05 
 
 
327 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  39.39 
 
 
581 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 
626 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  48.23 
 
 
150 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.86 
 
 
643 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  40.48 
 
 
317 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  37.91 
 
 
312 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  39.64 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 
597 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  35.56 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  36.46 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.97 
 
 
596 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
304 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  29.52 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.49 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  27.33 
 
 
607 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  29.59 
 
 
594 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  31.32 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  41.94 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  29.82 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  26.96 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  31.89 
 
 
1148 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  38.46 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  31.89 
 
 
1151 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.89 
 
 
1151 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  28.52 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  43.75 
 
 
242 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
449 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  26.34 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
449 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  34.85 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
449 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  40.22 
 
 
241 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  46.84 
 
 
149 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  40.74 
 
 
1108 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  31.37 
 
 
387 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.48 
 
 
1065 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  27.01 
 
 
1392 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  27.52 
 
 
304 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 
1139 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 
1138 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
275 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  35.09 
 
 
338 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  28.87 
 
 
225 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2063  FHA domain containing protein  33.9 
 
 
209 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32 
 
 
1141 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.29 
 
 
863 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10910  transcriptional regulator  31.87 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  29.13 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0139  FHA domain-containing protein  39.24 
 
 
179 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0141963  hitchhiker  0.00495704 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
665 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.57 
 
 
1149 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 
367 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2147  FHA domain-containing protein  30.3 
 
 
137 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.54 
 
 
851 aa  60.1  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0067  hypothetical protein  28.89 
 
 
220 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0032  FHA domain containing protein  30.89 
 
 
154 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 
680 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  27.99 
 
 
313 aa  59.3  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0175  FHA domain containing protein  35.53 
 
 
152 aa  59.3  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545255  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  26.92 
 
 
188 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0228001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  37.97 
 
 
154 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6476  FHA domain-containing protein  37.66 
 
 
158 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  45.31 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  32.37 
 
 
1094 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
1046 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  37.04 
 
 
219 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26940  FHA domain-containing protein  35.8 
 
 
175 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.216801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  38.03 
 
 
134 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.64 
 
 
518 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>