240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2558 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
304 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  87.58 
 
 
306 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  62.62 
 
 
317 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  40.42 
 
 
327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  50 
 
 
631 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  50.3 
 
 
622 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  49.7 
 
 
622 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  44.02 
 
 
603 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.76 
 
 
723 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  44.79 
 
 
664 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  45.45 
 
 
647 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  44.1 
 
 
667 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.02 
 
 
588 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  44.62 
 
 
647 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  45.99 
 
 
642 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  44.62 
 
 
652 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  49.1 
 
 
738 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
658 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  46.2 
 
 
648 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  42.79 
 
 
647 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  48.81 
 
 
629 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  41.77 
 
 
581 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  41.18 
 
 
595 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  46.43 
 
 
553 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  41.12 
 
 
598 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  49.11 
 
 
634 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  43.6 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  42.42 
 
 
624 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  38.8 
 
 
626 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.81 
 
 
643 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  35.56 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  40.34 
 
 
597 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40.51 
 
 
568 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  41.51 
 
 
568 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.48 
 
 
596 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  38.55 
 
 
408 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  48.84 
 
 
150 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  29.79 
 
 
594 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  36.59 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  31.55 
 
 
607 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  38.1 
 
 
680 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  32.66 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
1093 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  35.86 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  30.25 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  30.05 
 
 
1037 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  27.08 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  29.77 
 
 
1392 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 
665 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 
1094 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 
536 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  34.76 
 
 
1142 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  38.38 
 
 
471 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
1087 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
1156 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 
315 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 
320 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.56 
 
 
1180 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
1198 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.42 
 
 
577 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2301  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915403  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  30.08 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  35.95 
 
 
1134 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  32.12 
 
 
532 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 
612 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.51 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  32.04 
 
 
1065 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  32.29 
 
 
529 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  31.5 
 
 
526 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 
435 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  32.04 
 
 
1204 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  31.96 
 
 
275 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
469 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 
741 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  30.3 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  31.22 
 
 
1358 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  30.38 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 
662 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  26.82 
 
 
404 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  29.63 
 
 
614 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  28.92 
 
 
864 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 
1285 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  33.57 
 
 
633 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.57 
 
 
861 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.67 
 
 
354 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  27.96 
 
 
483 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1725  FHA domain containing protein  27.78 
 
 
781 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.184636  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 
561 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  27.83 
 
 
822 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  31.21 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  25.27 
 
 
638 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  28.78 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  34.59 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  34.59 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>