More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3142 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
302 aa  620  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  33.22 
 
 
306 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.46 
 
 
289 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  33.12 
 
 
294 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  32.53 
 
 
299 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  35.27 
 
 
295 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  30.87 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  30.69 
 
 
315 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  31.8 
 
 
313 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  29.84 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  27.95 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  26.95 
 
 
308 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  28.15 
 
 
304 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  29.77 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  38.17 
 
 
633 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 
472 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 
1392 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0259  forkhead-associated  23.72 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  38.41 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  39.1 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  38.17 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4106  adenylate/guanylate cyclase  33.82 
 
 
612 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0052  adenylate/guanylate cyclase  36.23 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  26.96 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.14 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0223  hypothetical protein  34.48 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  28.11 
 
 
1093 aa  72.8  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.19 
 
 
1149 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  34.01 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0694  FHA domain containing protein  24.4 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 
680 aa  69.3  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
1160 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
1139 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  29.52 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  30.12 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  29.52 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.11 
 
 
1138 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1918  hypothetical protein  41.86 
 
 
142 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.968576  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.82 
 
 
629 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.36 
 
 
1037 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  32.58 
 
 
400 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.49 
 
 
1141 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.28 
 
 
1087 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  28.31 
 
 
279 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 
381 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
417 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1725  FHA domain containing protein  26.14 
 
 
781 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.184636  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.41 
 
 
1148 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.49 
 
 
643 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30 
 
 
568 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  32.14 
 
 
1141 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.39 
 
 
737 aa  63.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.06 
 
 
631 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30 
 
 
725 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  27.68 
 
 
513 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  31.82 
 
 
330 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  26.85 
 
 
348 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.73 
 
 
701 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 
969 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  28.81 
 
 
355 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  27.32 
 
 
358 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2634  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.67 
 
 
226 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  28.65 
 
 
971 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.32 
 
 
588 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
531 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  25.41 
 
 
1151 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2493  adenylate/guanylate cyclase  35.76 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.41 
 
 
1151 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.93 
 
 
723 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.52 
 
 
805 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.25 
 
 
355 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  27.53 
 
 
1207 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0326  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.65 
 
 
628 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415974  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
607 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.31 
 
 
1142 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.48 
 
 
738 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2195  adenylate/guanylate cyclase  35.76 
 
 
255 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 
271 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  28.25 
 
 
355 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.56 
 
 
624 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  31.34 
 
 
462 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  37.8 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  31.21 
 
 
404 aa  59.7  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  26.82 
 
 
523 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  28.73 
 
 
487 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29 
 
 
568 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.82 
 
 
1020 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
597 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  25.65 
 
 
738 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  26.97 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>