253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4694 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
340 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  39.37 
 
 
384 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  33.23 
 
 
357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  31.97 
 
 
366 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  34.52 
 
 
361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  38.71 
 
 
354 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 
355 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.6 
 
 
355 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  36.54 
 
 
348 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 
355 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 
365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 
360 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
366 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.87 
 
 
375 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 
353 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  36.41 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 
353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  27.54 
 
 
353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
381 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  35.09 
 
 
363 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  29.07 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  29.07 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  29.07 
 
 
358 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  28.07 
 
 
355 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  27.75 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  29.56 
 
 
340 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 
357 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 
339 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  31.53 
 
 
342 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 
651 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  33.9 
 
 
469 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  31.38 
 
 
670 aa  73.6  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.32 
 
 
637 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 
701 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  31.77 
 
 
675 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  26.74 
 
 
758 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  35.11 
 
 
1134 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.72 
 
 
744 aa  67  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  26.74 
 
 
758 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 
643 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.03 
 
 
723 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
713 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.03 
 
 
723 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  33.69 
 
 
699 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 
752 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 
702 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.21 
 
 
737 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0326  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.56 
 
 
628 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415974  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 
645 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  26.11 
 
 
483 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  26.11 
 
 
483 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  27.07 
 
 
701 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  26.67 
 
 
701 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  27.83 
 
 
725 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  28.7 
 
 
459 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  25.54 
 
 
911 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.42 
 
 
764 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.45 
 
 
656 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.46 
 
 
797 aa  60.5  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  30.27 
 
 
645 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  25.99 
 
 
694 aa  59.7  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.09 
 
 
643 aa  59.7  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.45 
 
 
672 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  25.99 
 
 
641 aa  59.7  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  25.79 
 
 
759 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.72 
 
 
701 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 
681 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.14 
 
 
678 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.5 
 
 
753 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  30.34 
 
 
641 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  30.73 
 
 
589 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.92 
 
 
657 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  31.47 
 
 
593 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  28.11 
 
 
860 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.95 
 
 
758 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  27.72 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  35.58 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.27 
 
 
648 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.67 
 
 
613 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 
410 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  29.57 
 
 
1138 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.27 
 
 
981 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  24.86 
 
 
760 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.44 
 
 
618 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  27.32 
 
 
407 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.45 
 
 
622 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  30.32 
 
 
1156 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  26.25 
 
 
756 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.73 
 
 
618 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  28.04 
 
 
577 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  27.37 
 
 
553 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
425 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>