35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0223 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0223  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  336  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1918  hypothetical protein  45.24 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.968576  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 
320 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  30.36 
 
 
294 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  35.48 
 
 
306 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0259  forkhead-associated  25.23 
 
 
327 aa  54.3  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  38.1 
 
 
310 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0694  FHA domain containing protein  30.69 
 
 
290 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  34.67 
 
 
299 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.92 
 
 
289 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  40 
 
 
313 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  42.62 
 
 
268 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0031  FHA domain containing protein  46.15 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.74184  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.21 
 
 
1004 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  31.07 
 
 
304 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  37.65 
 
 
315 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  47.92 
 
 
398 aa  44.7  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  30.49 
 
 
304 aa  44.7  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 
315 aa  44.7  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  44.19 
 
 
694 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  50 
 
 
288 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00230  FHA domain-containing protein  44.68 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.853372  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  30.16 
 
 
294 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  38.04 
 
 
253 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 
295 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2321  FHA domain-containing protein  32.63 
 
 
97 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 
308 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0330  FHA domain-containing protein  42 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  44.64 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26940  FHA domain-containing protein  42.22 
 
 
175 aa  41.6  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.216801  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  39.22 
 
 
154 aa  41.2  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2158  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
306 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  42 
 
 
144 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0030  FHA domain containing protein  40.43 
 
 
169 aa  40.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>