More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3464 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  100 
 
 
694 aa  1338    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  34.84 
 
 
474 aa  257  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  32.25 
 
 
569 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  32.94 
 
 
639 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  31.68 
 
 
572 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  31.22 
 
 
589 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  30.82 
 
 
594 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  27.02 
 
 
638 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  31.14 
 
 
568 aa  225  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  27.22 
 
 
634 aa  220  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
742 aa  218  2.9999999999999998e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  0.00000000000153533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
491 aa  215  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  30.52 
 
 
563 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  33.7 
 
 
471 aa  210  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  32.87 
 
 
498 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  33.15 
 
 
495 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  31.19 
 
 
437 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  33.06 
 
 
444 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  31.77 
 
 
437 aa  208  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  27.82 
 
 
473 aa  208  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  30.02 
 
 
455 aa  207  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  29.41 
 
 
560 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  29.78 
 
 
455 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  30.47 
 
 
460 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  31.34 
 
 
463 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  28.48 
 
 
463 aa  205  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  30.08 
 
 
677 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  28.78 
 
 
464 aa  204  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  31.34 
 
 
462 aa  204  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  26.91 
 
 
469 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  31.79 
 
 
465 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  30.45 
 
 
455 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  30.95 
 
 
455 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
457 aa  201  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  29.25 
 
 
454 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  29.25 
 
 
454 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  30.7 
 
 
472 aa  200  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  30.59 
 
 
455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  31.06 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  29.03 
 
 
454 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  30.59 
 
 
455 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  31.52 
 
 
491 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  30.59 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  31.36 
 
 
523 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  31.3 
 
 
458 aa  198  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  31.36 
 
 
520 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  31.36 
 
 
520 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  31.36 
 
 
520 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  31.36 
 
 
521 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  29.54 
 
 
455 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  31.41 
 
 
515 aa  197  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  31.41 
 
 
523 aa  197  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  27.9 
 
 
441 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  30.47 
 
 
624 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  29.68 
 
 
454 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  29.71 
 
 
453 aa  196  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  29.93 
 
 
445 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  27.36 
 
 
472 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  30.19 
 
 
452 aa  195  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  34.27 
 
 
449 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  29.66 
 
 
456 aa  194  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  28.64 
 
 
481 aa  193  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  30.92 
 
 
442 aa  193  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  28.81 
 
 
467 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  29.17 
 
 
459 aa  191  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  28.41 
 
 
496 aa  191  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  32.16 
 
 
468 aa  191  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  31.45 
 
 
474 aa  191  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.56 
 
 
467 aa  191  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  31.5 
 
 
430 aa  191  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  31.69 
 
 
470 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  29.44 
 
 
498 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  26.95 
 
 
508 aa  190  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  31.72 
 
 
472 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  30 
 
 
449 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  28.14 
 
 
468 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  27.47 
 
 
454 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  30.56 
 
 
432 aa  188  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.56 
 
 
466 aa  188  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  32.27 
 
 
416 aa  188  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  29.61 
 
 
457 aa  188  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  29.34 
 
 
476 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  31.15 
 
 
465 aa  187  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  27.32 
 
 
479 aa  187  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  32.7 
 
 
472 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  28.22 
 
 
437 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  28.64 
 
 
487 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  30.14 
 
 
485 aa  184  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  30.19 
 
 
484 aa  183  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  29.05 
 
 
458 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  27.43 
 
 
478 aa  182  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5621  type II secretion system protein E  30.46 
 
 
632 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  28.7 
 
 
463 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7220  type II secretion system protein E  30.22 
 
 
632 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177916  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  27.79 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  28.54 
 
 
521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  32.06 
 
 
417 aa  181  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  27.38 
 
 
477 aa  181  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  28.15 
 
 
608 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  30.47 
 
 
485 aa  180  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>