More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1756 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  100 
 
 
430 aa  879    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  47.49 
 
 
472 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  45.05 
 
 
463 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  49.22 
 
 
444 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  47.4 
 
 
463 aa  365  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  47.4 
 
 
465 aa  364  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  44.74 
 
 
469 aa  360  3e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  45.82 
 
 
468 aa  359  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  45.9 
 
 
472 aa  359  5e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  46.05 
 
 
491 aa  359  6e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  45.76 
 
 
467 aa  359  7e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  45.43 
 
 
460 aa  359  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  47.3 
 
 
487 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  47.46 
 
 
468 aa  355  7.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  46.58 
 
 
456 aa  355  7.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  48.5 
 
 
560 aa  354  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4155  type II secretion system protein E  48.9 
 
 
471 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  45.77 
 
 
454 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  47.54 
 
 
473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  44.85 
 
 
455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  45.52 
 
 
442 aa  353  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  45.1 
 
 
455 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  47.97 
 
 
465 aa  352  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  44.67 
 
 
462 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  45.1 
 
 
455 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  48.78 
 
 
452 aa  352  7e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  45.1 
 
 
455 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  44.88 
 
 
453 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  48.08 
 
 
624 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  46.92 
 
 
459 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  44.36 
 
 
455 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  44.76 
 
 
445 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  44.12 
 
 
455 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  46.63 
 
 
479 aa  349  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  43.96 
 
 
464 aa  349  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  44.31 
 
 
467 aa  349  6e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  44.12 
 
 
441 aa  348  9e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  44.12 
 
 
455 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  45.54 
 
 
442 aa  347  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  45.52 
 
 
572 aa  346  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  48.23 
 
 
498 aa  346  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3352  type II secretion system protein E  47.79 
 
 
471 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.695645  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  43.87 
 
 
454 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  43.87 
 
 
454 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  47.31 
 
 
478 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  43.87 
 
 
454 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  47.45 
 
 
477 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  45.7 
 
 
454 aa  343  5e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  45.15 
 
 
463 aa  342  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  46.44 
 
 
589 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  47.67 
 
 
495 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  48.55 
 
 
634 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  47.86 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  50.15 
 
 
449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  43.03 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  44.95 
 
 
569 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  46.83 
 
 
504 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  48.38 
 
 
437 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  48.65 
 
 
437 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  46.36 
 
 
449 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  43.82 
 
 
451 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  41.57 
 
 
432 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  49.43 
 
 
474 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  44.95 
 
 
450 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  48.63 
 
 
457 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  44.7 
 
 
452 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  45.16 
 
 
472 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  46.56 
 
 
471 aa  332  8e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  46.01 
 
 
467 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  45.99 
 
 
515 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  45.16 
 
 
472 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  45.74 
 
 
521 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  45.74 
 
 
520 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  48.28 
 
 
476 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  47.55 
 
 
508 aa  331  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  45.74 
 
 
520 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  45.74 
 
 
520 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  46.02 
 
 
470 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  45.74 
 
 
523 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  45.74 
 
 
523 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  46.35 
 
 
608 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  46.03 
 
 
482 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  45.15 
 
 
457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  46.03 
 
 
490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  46.2 
 
 
677 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  45.1 
 
 
491 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  48.96 
 
 
477 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  48.22 
 
 
638 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  44.36 
 
 
485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  45.98 
 
 
481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  44.71 
 
 
437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  44.39 
 
 
480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  48.96 
 
 
482 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  45.18 
 
 
484 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  45.45 
 
 
433 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  46.03 
 
 
489 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  41.57 
 
 
482 aa  325  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  47.81 
 
 
488 aa  325  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  44.44 
 
 
496 aa  323  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  47.18 
 
 
485 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>