More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3116 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  100 
 
 		 491 aa  971    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  60.25 
 
 		 470 aa  561  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  55.76 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  57.2 
 
 		 465 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  60.48 
 
 		 444 aa  510  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  61 
 
 		 468 aa  505  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  53.77 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  53.66 
 
 		 498 aa  502  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  55.31 
 
 		 463 aa  498  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  59.33 
 
 		 495 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  53.52 
 
 		 491 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  56.7 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  56.5 
 
 		 463 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  54.92 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  52.75 
 
 		 677 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  51.01 
 
 		 451 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  49.1 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  54.5 
 
 		 468 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  49.57 
 
 		 477 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  52.86 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  51.41 
 
 		 467 aa  448  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  49.21 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  50.6 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  53.01 
 
 		 452 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  50.97 
 
 		 460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  49.21 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  53.07 
 
 		 450 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  49.21 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  47.62 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  49.24 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  55.41 
 
 		 487 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  50.82 
 
 		 624 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  49.16 
 
 		 454 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  49.16 
 
 		 454 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  49.16 
 
 		 454 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4155  type II secretion system protein E  65.29 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  50.24 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  46.48 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  52.02 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  47.07 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  49.49 
 
 		 560 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  50.6 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  50.99 
 
 		 454 aa  438  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  46.83 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  46.83 
 
 		 455 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3352  type II secretion system protein E  64.2 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.695645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  50.99 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  49.1 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  46.62 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  49.16 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  52.26 
 
 		 638 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  52.62 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  51.49 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  52.76 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  48.66 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  47.46 
 
 		 463 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  52.85 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  51.32 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  50.24 
 
 		 437 aa  425  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  51.44 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  49.28 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  50 
 
 		 437 aa  428  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  47.02 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  48.73 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  51.98 
 
 		 437 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  48.68 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  50.12 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  48.66 
 
 		 485 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  46.87 
 
 		 489 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  49.64 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  47.36 
 
 		 589 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  52.09 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  50.37 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  49.3 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  49.63 
 
 		 482 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  48.85 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  46.97 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  49.08 
 
 		 482 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  49.39 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  53.87 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  56.87 
 
 		 594 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  51.72 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  45.82 
 
 		 508 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  51.77 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  47.88 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  55.83 
 
 		 608 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  52.76 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  46.87 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  47.46 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  47.22 
 
 		 482 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  46.87 
 
 		 488 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  53 
 
 		 563 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  51.57 
 
 		 483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  48.79 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  49.39 
 
 		 485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  48.75 
 
 		 484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  48.06 
 
 		 476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  52.13 
 
 		 639 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>