More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0644 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 569 aa  1170    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  81.61 
 
 		 572 aa  969    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  75.04 
 
 		 589 aa  904    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  51.38 
 
 		 634 aa  598  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  51.45 
 
 		 638 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  52.97 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  54.78 
 
 		 568 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  54.83 
 
 		 563 aa  581  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  48.59 
 
 		 639 aa  545  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  61.87 
 
 		 474 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  54.23 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  53.2 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  56.09 
 
 		 465 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  56.42 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  52.74 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  53.73 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  51.9 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  48.36 
 
 		 455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  51.07 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  51.07 
 
 		 454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  52.02 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  51.07 
 
 		 454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  54.22 
 
 		 677 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  54.39 
 
 		 467 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  51.07 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  61.84 
 
 		 457 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  51.31 
 
 		 464 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  51.07 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  51.9 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  50.59 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  51.07 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  50.36 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  50.83 
 
 		 455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  51.07 
 
 		 454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  50.59 
 
 		 460 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  52.56 
 
 		 742 aa  443  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  0.00000000000153533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  51.97 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  47.45 
 
 		 487 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  50.24 
 
 		 469 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  56.39 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  49.25 
 
 		 479 aa  432  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  46.94 
 
 		 472 aa  432  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  51.43 
 
 		 452 aa  432  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  48.32 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  50.36 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  54.99 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  56.94 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  48.97 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  49.28 
 
 		 454 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  48.44 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  52.83 
 
 		 465 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  51.4 
 
 		 498 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  48.08 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  50.36 
 
 		 624 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  51.44 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  48.74 
 
 		 560 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  49.4 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  48.01 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  50.49 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  50 
 
 		 471 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  53.53 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  47.76 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  44.59 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  52.66 
 
 		 470 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  48.56 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  50.84 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  46.41 
 
 		 608 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  50.61 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  50.24 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  48.41 
 
 		 467 aa  412  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  49.05 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  51.44 
 
 		 437 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  49.76 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  55.28 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  46.75 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  51.26 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  50.24 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  46.05 
 
 		 484 aa  401  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  49.16 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  48.25 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  49.39 
 
 		 523 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  46.28 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  48.9 
 
 		 523 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  51.01 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  49.14 
 
 		 521 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  49.39 
 
 		 515 aa  399  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  55.4 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  49.14 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  45.69 
 
 		 508 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  49.14 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  49.14 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  46.72 
 
 		 474 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  45.89 
 
 		 476 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  47.48 
 
 		 466 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  55.86 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  51.42 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  51.99 
 
 		 483 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  49.87 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>