More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1640 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  100 
 
 
417 aa  847    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  57.63 
 
 
438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  59.15 
 
 
421 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  59.4 
 
 
421 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  58.78 
 
 
418 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  58.78 
 
 
418 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  57 
 
 
418 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0646  type II secretion system protein E  59.4 
 
 
423 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358361  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  50.5 
 
 
455 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  50.99 
 
 
454 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  50.97 
 
 
447 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  50.74 
 
 
450 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  50.74 
 
 
450 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  50.74 
 
 
450 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  49.63 
 
 
451 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  49.39 
 
 
450 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  49.26 
 
 
440 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  49.75 
 
 
447 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  49.75 
 
 
447 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  50 
 
 
447 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  49.26 
 
 
446 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  50 
 
 
469 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  49.63 
 
 
451 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  50 
 
 
469 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  49.01 
 
 
438 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  49.75 
 
 
447 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  49.26 
 
 
438 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  50 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  50.24 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  49.25 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  46.83 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  50.91 
 
 
445 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  49.34 
 
 
455 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  49.61 
 
 
455 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  49.34 
 
 
455 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  50.54 
 
 
456 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  51.66 
 
 
455 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  49.34 
 
 
455 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  50.26 
 
 
624 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  50.13 
 
 
444 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  51.31 
 
 
450 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  51.38 
 
 
455 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  55.22 
 
 
452 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  50 
 
 
454 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  49.07 
 
 
453 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  49.73 
 
 
459 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  48.47 
 
 
408 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  51.62 
 
 
474 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  46.49 
 
 
442 aa  372  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  48.75 
 
 
451 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  49.73 
 
 
455 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  48.26 
 
 
479 aa  372  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  48.4 
 
 
472 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  49.46 
 
 
454 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  48.81 
 
 
478 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  51.38 
 
 
467 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  50.53 
 
 
452 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  51.23 
 
 
408 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  49.46 
 
 
454 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  49.46 
 
 
454 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  47.78 
 
 
460 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  49.87 
 
 
458 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  50.13 
 
 
467 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  47.61 
 
 
462 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  48.55 
 
 
464 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  50.4 
 
 
466 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  54.04 
 
 
477 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  47.61 
 
 
454 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  49.44 
 
 
463 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  47.75 
 
 
463 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  54.95 
 
 
455 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  46.68 
 
 
473 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  51.97 
 
 
432 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  48.86 
 
 
608 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  51.2 
 
 
462 aa  364  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  52.25 
 
 
468 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  53.61 
 
 
560 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  47.76 
 
 
500 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  49.48 
 
 
449 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  47.72 
 
 
481 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  47.47 
 
 
467 aa  362  6e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  52.25 
 
 
469 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  48.52 
 
 
476 aa  362  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  47.31 
 
 
463 aa  361  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  47.35 
 
 
442 aa  361  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  47.85 
 
 
465 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  47.33 
 
 
467 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  51.94 
 
 
472 aa  360  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  49.45 
 
 
457 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  46.37 
 
 
489 aa  360  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  47.15 
 
 
492 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  47.57 
 
 
639 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  45.95 
 
 
482 aa  359  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  47.06 
 
 
490 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  46.32 
 
 
484 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  47.11 
 
 
482 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  46.68 
 
 
482 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  48.6 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  46.58 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  47.09 
 
 
504 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>