More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7220 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5621  type II secretion system protein E  97.78 
 
 		 632 aa  1253    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7220  type II secretion system protein E  100 
 
 		 632 aa  1288    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177916  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  50.97 
 
 		 639 aa  346  8e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  52.51 
 
 		 594 aa  342  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  51.21 
 
 		 563 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  47.64 
 
 		 634 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  46.91 
 
 		 638 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  51.16 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  49.56 
 
 		 572 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  54.69 
 
 		 444 aa  330  6e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  50.15 
 
 		 569 aa  330  7e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  49.85 
 
 		 589 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  45.85 
 
 		 442 aa  317  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  49.42 
 
 		 472 aa  317  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  43.1 
 
 		 487 aa  317  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  44.55 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  51.03 
 
 		 568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  46.47 
 
 		 463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  44.85 
 
 		 465 aa  312  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  42.79 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  48.7 
 
 		 455 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  43.38 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  46.52 
 
 		 455 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  48.12 
 
 		 428 aa  306  6e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  44.06 
 
 		 478 aa  306  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  49.04 
 
 		 521 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  49.04 
 
 		 523 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  44.87 
 
 		 456 aa  306  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  48.41 
 
 		 454 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  49.04 
 
 		 523 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  48.41 
 
 		 454 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  49.04 
 
 		 520 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  49.04 
 
 		 520 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  49.04 
 
 		 520 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  47.08 
 
 		 454 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  48.59 
 
 		 515 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2488  type II secretion system protein E  48.61 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273965 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  46.52 
 
 		 455 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  46.78 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  47.65 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  42.86 
 
 		 455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  42.08 
 
 		 467 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  45.94 
 
 		 453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  42.75 
 
 		 462 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  44.76 
 
 		 459 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  41.44 
 
 		 477 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  48.4 
 
 		 677 aa  303  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  45.68 
 
 		 451 aa  303  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  50.32 
 
 		 432 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  42.63 
 
 		 455 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  45.4 
 
 		 464 aa  302  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  43.19 
 
 		 454 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  42.63 
 
 		 455 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  48.88 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  49.04 
 
 		 513 aa  301  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  42.63 
 
 		 455 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  49.7 
 
 		 491 aa  300  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  42.82 
 
 		 469 aa  300  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  43.37 
 
 		 412 aa  300  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  50.49 
 
 		 445 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  48.73 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  48.73 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  49.71 
 
 		 468 aa  297  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  40.67 
 
 		 450 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  47.98 
 
 		 452 aa  297  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  50.17 
 
 		 452 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  48.08 
 
 		 474 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  47.42 
 
 		 416 aa  296  6e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  49.55 
 
 		 498 aa  296  8e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  47.71 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  49.55 
 
 		 457 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  49.85 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 468 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  47.97 
 
 		 467 aa  294  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  47.94 
 
 		 482 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  45.17 
 
 		 457 aa  294  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  48.7 
 
 		 472 aa  293  6e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  44.44 
 
 		 428 aa  293  7e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 428 aa  293  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  44.44 
 
 		 428 aa  293  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  45.13 
 
 		 624 aa  293  8e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  42.03 
 
 		 449 aa  292  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  49.56 
 
 		 471 aa  293  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  41.44 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  46.67 
 
 		 433 aa  291  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  48.01 
 
 		 462 aa  291  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  47.63 
 
 		 423 aa  291  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  46.67 
 
 		 484 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  49.5 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  41.34 
 
 		 454 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  46.86 
 
 		 478 aa  290  7e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  46.36 
 
 		 458 aa  290  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  46.06 
 
 		 467 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  46.36 
 
 		 490 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  49.49 
 
 		 445 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  45.58 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  45.15 
 
 		 488 aa  287  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  46.38 
 
 		 463 aa  287  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  44.51 
 
 		 489 aa  287  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  46.15 
 
 		 608 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>