More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2290 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  74.86 
 
 
521 aa  742    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  78.01 
 
 
521 aa  811    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  100 
 
 
498 aa  1017    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  52.57 
 
 
483 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  52.48 
 
 
521 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  49.22 
 
 
515 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  52.48 
 
 
523 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  52.48 
 
 
523 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  52.24 
 
 
482 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  53.38 
 
 
480 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  51.36 
 
 
482 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  51.36 
 
 
482 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  52.81 
 
 
476 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  52.9 
 
 
504 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  52.48 
 
 
520 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  54.32 
 
 
485 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  52.48 
 
 
520 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  52.48 
 
 
520 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  52.58 
 
 
455 aa  435  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  52.24 
 
 
478 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  47.47 
 
 
488 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  49.76 
 
 
432 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  52.71 
 
 
477 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  53.96 
 
 
485 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  51.42 
 
 
490 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  51.9 
 
 
484 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  52.35 
 
 
491 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  51.96 
 
 
488 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  52.59 
 
 
491 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  52.45 
 
 
467 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  52.7 
 
 
433 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  52.71 
 
 
482 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  53.68 
 
 
500 aa  432  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  50.58 
 
 
508 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  48.87 
 
 
462 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  50.59 
 
 
482 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  47.57 
 
 
492 aa  432  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  49.56 
 
 
492 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  45.98 
 
 
489 aa  428  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  51.52 
 
 
472 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  51.12 
 
 
472 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  50.61 
 
 
441 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  56.08 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  45.49 
 
 
474 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  48.05 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  51.34 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  46.48 
 
 
467 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  49.87 
 
 
481 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  47.06 
 
 
464 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  49.88 
 
 
466 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  46.62 
 
 
459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  51.74 
 
 
445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  51.91 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  47.63 
 
 
451 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  45.83 
 
 
455 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  47.19 
 
 
456 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  45.83 
 
 
455 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  47.84 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  45.97 
 
 
496 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  49.54 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  49.87 
 
 
624 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  48.04 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  46.37 
 
 
485 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  46.23 
 
 
455 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  46.04 
 
 
560 aa  398  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  47.45 
 
 
452 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  47.22 
 
 
450 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  46.44 
 
 
445 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  45.21 
 
 
454 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  45.21 
 
 
454 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  45.21 
 
 
454 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  46.9 
 
 
463 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  47.22 
 
 
465 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  48.42 
 
 
463 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  46.37 
 
 
485 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  46.65 
 
 
472 aa  391  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  46.9 
 
 
452 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  45.89 
 
 
454 aa  392  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  50.12 
 
 
437 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  45.91 
 
 
484 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  44.03 
 
 
479 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  44.5 
 
 
455 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  44.06 
 
 
454 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  48.72 
 
 
463 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  45.56 
 
 
457 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  47.04 
 
 
473 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  47.17 
 
 
469 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  50 
 
 
472 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  46.47 
 
 
460 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  44.26 
 
 
455 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  48.64 
 
 
452 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  44.03 
 
 
455 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  44.03 
 
 
455 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  46.12 
 
 
453 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  42.8 
 
 
477 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  52.12 
 
 
569 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  46.15 
 
 
491 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  44.76 
 
 
589 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  47.49 
 
 
467 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  49 
 
 
416 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>