More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3060 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5252  FHA domain containing protein  79.22 
 
 
255 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.691426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  71.21 
 
 
245 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0069  FHA domain containing protein  70.87 
 
 
250 aa  353  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0117  FHA domain-containing protein-like protein  70.47 
 
 
246 aa  344  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0077  FHA domain containing protein  49.22 
 
 
234 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.43292  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4430  FHA domain-containing protein  46.85 
 
 
440 aa  205  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.206404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0024  FHA domain-containing protein  46.18 
 
 
280 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0032  FHA domain containing protein  43.03 
 
 
235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0140  FHA domain-containing protein  44.75 
 
 
533 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425814  hitchhiker  0.00649643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0041  FHA domain containing protein  38.89 
 
 
270 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0176  FHA domain containing protein  40.24 
 
 
238 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.74043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0028  forkhead-associated protein  43.63 
 
 
238 aa  175  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.791659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2647  FHA domain containing protein  42.4 
 
 
234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00240  FHA domain-containing protein  40.64 
 
 
239 aa  172  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0042  FHA domain-containing protein  43.3 
 
 
262 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179739  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0024  FHA domain containing protein  41.04 
 
 
235 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0033  FHA domain containing protein  65.32 
 
 
342 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0031  FHA domain containing protein  38.65 
 
 
235 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0047  FHA domain-containing protein  42.86 
 
 
253 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1377  hypothetical protein  38.65 
 
 
233 aa  162  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6477  FHA domain-containing protein  40.23 
 
 
246 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0374778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0026  FHA domain containing protein  35.71 
 
 
247 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0036  FHA domain protein  35.86 
 
 
233 aa  149  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26930  FHA domain-containing protein  37.45 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.583878  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0026  FHA domain-containing protein  35.57 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  33.21 
 
 
280 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
252 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  32.18 
 
 
252 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  33.2 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  32.27 
 
 
242 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  30.4 
 
 
268 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  31.47 
 
 
238 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  25.63 
 
 
279 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
241 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  34.26 
 
 
242 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00810  FHA domain-containing protein  28.52 
 
 
303 aa  99.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0576039  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00240  FHA domain-containing protein  40.77 
 
 
402 aa  99.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0029  FHA domain-containing protein  37.42 
 
 
470 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0027  FHA domain containing protein  43.55 
 
 
420 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0083  FHA domain containing protein  39.34 
 
 
394 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  25.82 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  30.57 
 
 
219 aa  89.4  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  38.84 
 
 
428 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0021  FHA domain-containing protein  36.69 
 
 
469 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0541775  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0029  FHA domain-containing protein  36.69 
 
 
469 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551957  hitchhiker  0.00992871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0021  FHA domain-containing protein  36.69 
 
 
469 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.371032  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0806  FHA domain-containing protein  39.67 
 
 
478 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  37.19 
 
 
406 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0031  Forkhead-associated protein  48.28 
 
 
433 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10020  hypothetical protein  48.19 
 
 
527 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  39.29 
 
 
474 aa  76.3  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  51.95 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  51.95 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  50.65 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  52.11 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  43.21 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  47.69 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  32.48 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1125  FHA domain containing protein  44.44 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  40.51 
 
 
408 aa  65.5  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3612  FHA domain containing protein  37.93 
 
 
514 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  hitchhiker  0.00187032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5913  diguanylate cyclase  35.25 
 
 
364 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  41.56 
 
 
946 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0237  ATP-binding region ATPase domain protein  51.67 
 
 
567 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11857  hypothetical protein  42.86 
 
 
162 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.751406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  46.15 
 
 
427 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5356  FHA domain containing protein  40.26 
 
 
150 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  43.84 
 
 
134 aa  62  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  45 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  37.97 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  36.47 
 
 
1108 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0921  FHA domain containing protein  36.79 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13850  FHA domain-containing protein  40.21 
 
 
141 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22590  FHA domain-containing protein  40.26 
 
 
152 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5627  FHA domain containing protein  44.44 
 
 
767 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.201198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  41.56 
 
 
863 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  45.95 
 
 
189 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  41.18 
 
 
152 aa  60.1  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  29.66 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4329  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24475  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  45.83 
 
 
149 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  36.84 
 
 
770 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1542  FHA domain containing protein  35.71 
 
 
158 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.29 
 
 
856 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3863  FHA domain-containing protein  33 
 
 
503 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.312796  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0147  FHA domain containing protein  37.8 
 
 
137 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3135  FHA domain-containing protein  41.56 
 
 
157 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547801  normal  0.0667215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4223  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.03 
 
 
449 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168006  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  41.56 
 
 
183 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.82 
 
 
606 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2501  FHA domain-containing protein  42.05 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320482  decreased coverage  0.000381992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  34.48 
 
 
518 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2775  Forkhead-associated protein  41.56 
 
 
149 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3613  FHA domain containing protein  42.31 
 
 
157 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  hitchhiker  0.00128978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  41.33 
 
 
895 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  41.56 
 
 
158 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1738  FHA domain containing protein  33.04 
 
 
156 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148575  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3427  hypothetical protein  33 
 
 
503 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281438  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1780  FHA domain-containing protein  43.84 
 
 
154 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257566  normal  0.0327167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>