More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1183 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  78.78 
 
 		 849 aa  1032    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  71.97 
 
 		 856 aa  1159    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  76.93 
 
 		 933 aa  1088    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  57.42 
 
 		 851 aa  922    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 895 aa  1771    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  57.23 
 
 		 838 aa  886    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  47.44 
 
 		 777 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  48.91 
 
 		 1108 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.72 
 
 		 910 aa  495  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  37.06 
 
 		 869 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  36.58 
 
 		 861 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.16 
 
 		 851 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  35.94 
 
 		 866 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  36.06 
 
 		 866 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  36.06 
 
 		 866 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  35.8 
 
 		 863 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 848 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  44.06 
 
 		 702 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.61 
 
 		 863 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.15 
 
 		 878 aa  318  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.04 
 
 		 1004 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.53 
 
 		 899 aa  304  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  34.31 
 
 		 796 aa  303  9e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.04 
 
 		 903 aa  296  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.85 
 
 		 890 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.02 
 
 		 802 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.28 
 
 		 799 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.65 
 
 		 799 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  30 
 
 		 770 aa  230  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  29.29 
 
 		 972 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  27.73 
 
 		 590 aa  160  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  31.11 
 
 		 298 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  34.51 
 
 		 313 aa  126  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  27.15 
 
 		 741 aa  125  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 		 248 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  27.48 
 
 		 635 aa  124  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  27.18 
 
 		 556 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 241 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  32.16 
 
 		 1033 aa  121  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 241 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  34.36 
 
 		 235 aa  121  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 		 248 aa  121  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  26.05 
 
 		 641 aa  121  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  24.78 
 
 		 1194 aa  120  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 252 aa  120  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  32.74 
 
 		 241 aa  120  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  33.33 
 
 		 329 aa  120  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  36.99 
 
 		 1275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  31.78 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.03 
 
 		 369 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  33.03 
 
 		 308 aa  119  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.96 
 
 		 568 aa  119  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  34.81 
 
 		 322 aa  119  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 252 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 322 aa  118  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  30.57 
 
 		 315 aa  118  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 241 aa  118  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  33.48 
 
 		 308 aa  118  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 241 aa  118  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  27.81 
 
 		 1466 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0515148 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  26.54 
 
 		 810 aa  117  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  28.52 
 
 		 1253 aa  117  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  32.74 
 
 		 327 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  35.07 
 
 		 320 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  32.49 
 
 		 322 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  32.3 
 
 		 311 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  29.32 
 
 		 310 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  29.23 
 
 		 319 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 222 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  32.64 
 
 		 317 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 222 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32 
 
 		 301 aa  117  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  35 
 
 		 1090 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  33.78 
 
 		 302 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 		 319 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  31.78 
 
 		 326 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  30.3 
 
 		 255 aa  115  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  31.17 
 
 		 307 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  31.27 
 
 		 304 aa  114  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 302 aa  114  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  32.85 
 
 		 332 aa  114  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  30.73 
 
 		 303 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.26 
 
 		 343 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  33.03 
 
 		 300 aa  114  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94849  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  29.25 
 
 		 664 aa  114  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.855588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 		 309 aa  114  9e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  34.96 
 
 		 256 aa  114  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  33.33 
 
 		 324 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  34.27 
 
 		 323 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  31.27 
 
 		 282 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  36.97 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.67 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  31.84 
 
 		 335 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7397  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  36 
 
 		 290 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  31.76 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  35.87 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 331 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  33.05 
 
 		 588 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4124  ABC transporter related  36 
 
 		 291 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>