More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6707 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  100 
 
 
1108 aa  2180    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  49.7 
 
 
851 aa  622  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  49.5 
 
 
777 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  50.92 
 
 
933 aa  585  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  49.38 
 
 
838 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  49.08 
 
 
856 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  49.29 
 
 
895 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  51.57 
 
 
849 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  46.74 
 
 
910 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  46.58 
 
 
702 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.91 
 
 
851 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  39.2 
 
 
866 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  39.2 
 
 
866 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  38.75 
 
 
866 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  40.71 
 
 
863 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  39.78 
 
 
861 aa  416  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  39.91 
 
 
869 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  34.36 
 
 
848 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.24 
 
 
863 aa  369  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.2 
 
 
890 aa  358  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.91 
 
 
899 aa  354  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.04 
 
 
1004 aa  354  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.63 
 
 
903 aa  347  7e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  34.13 
 
 
796 aa  340  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.32 
 
 
878 aa  338  3.9999999999999995e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.63 
 
 
799 aa  327  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.53 
 
 
799 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.5 
 
 
802 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  60.15 
 
 
622 aa  306  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  60.15 
 
 
541 aa  289  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  52.42 
 
 
626 aa  282  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  56.69 
 
 
484 aa  280  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  52.81 
 
 
1358 aa  279  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  51.25 
 
 
574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  48.68 
 
 
586 aa  271  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  51.25 
 
 
561 aa  271  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  46.94 
 
 
664 aa  270  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  49.65 
 
 
583 aa  268  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  48.67 
 
 
527 aa  267  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1066  protein kinase  57.2 
 
 
486 aa  267  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  54.12 
 
 
604 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  54.12 
 
 
604 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  54.12 
 
 
604 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  31.27 
 
 
770 aa  258  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3400  serine/threonine protein kinase  57.98 
 
 
522 aa  258  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3463  protein kinase  57.98 
 
 
522 aa  258  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0363324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3411  protein kinase  57.98 
 
 
522 aa  258  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  49.69 
 
 
518 aa  248  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  53.97 
 
 
530 aa  244  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  45.2 
 
 
659 aa  243  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  42.93 
 
 
566 aa  231  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  48.88 
 
 
349 aa  227  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  39.87 
 
 
519 aa  220  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  42.34 
 
 
618 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  34.99 
 
 
746 aa  212  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 
776 aa  210  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  39.42 
 
 
671 aa  209  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  42.24 
 
 
444 aa  206  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
377 aa  205  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.94 
 
 
916 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  43.05 
 
 
661 aa  202  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  38.17 
 
 
419 aa  201  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.64 
 
 
511 aa  201  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  43.77 
 
 
599 aa  197  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  43.82 
 
 
571 aa  197  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.61 
 
 
676 aa  196  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  39.54 
 
 
587 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3625  protein kinase  41.75 
 
 
665 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160356  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  39.54 
 
 
587 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  39.54 
 
 
587 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.85 
 
 
584 aa  195  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  41.82 
 
 
569 aa  195  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 
545 aa  193  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1234  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
539 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  38.79 
 
 
1057 aa  193  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  41.18 
 
 
589 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  42.96 
 
 
557 aa  192  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.22 
 
 
438 aa  190  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.01 
 
 
668 aa  190  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  39.36 
 
 
632 aa  189  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
430 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  42.21 
 
 
642 aa  188  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
430 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
431 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.63 
 
 
681 aa  187  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  38.86 
 
 
585 aa  187  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  41.08 
 
 
646 aa  187  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.72 
 
 
603 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  42.63 
 
 
576 aa  187  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  42.63 
 
 
576 aa  187  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.76 
 
 
647 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.85 
 
 
664 aa  186  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  38.57 
 
 
615 aa  186  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  41.57 
 
 
623 aa  186  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  41.57 
 
 
623 aa  186  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  41.57 
 
 
621 aa  185  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.41 
 
 
648 aa  184  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
790 aa  184  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  39.56 
 
 
863 aa  184  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  39.01 
 
 
626 aa  183  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>