More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3935 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  100 
 
 
899 aa  1832    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  53.17 
 
 
878 aa  890    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  88.74 
 
 
903 aa  1610    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  60.64 
 
 
863 aa  1028    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  37.86 
 
 
796 aa  488  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.78 
 
 
802 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.21 
 
 
1004 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.89 
 
 
799 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.71 
 
 
799 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.93 
 
 
890 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.9 
 
 
777 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  38.67 
 
 
1108 aa  345  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  34.56 
 
 
851 aa  340  8e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.7 
 
 
910 aa  339  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.86 
 
 
838 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.35 
 
 
856 aa  323  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.65 
 
 
849 aa  319  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  33.58 
 
 
895 aa  312  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  31.65 
 
 
869 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  31.15 
 
 
863 aa  304  6.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.94 
 
 
933 aa  303  7.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  33.88 
 
 
702 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  39.11 
 
 
770 aa  275  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.3 
 
 
851 aa  243  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  39.23 
 
 
866 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  39.23 
 
 
866 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  39.23 
 
 
866 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  38.6 
 
 
861 aa  234  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
848 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  27.54 
 
 
1194 aa  168  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  27.66 
 
 
590 aa  156  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  33.68 
 
 
972 aa  145  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  31.85 
 
 
328 aa  140  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  34.88 
 
 
585 aa  134  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 
248 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 
241 aa  128  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 
248 aa  127  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  26.67 
 
 
1271 aa  127  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 
241 aa  126  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  24.59 
 
 
515 aa  125  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  26.59 
 
 
1033 aa  125  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  37.55 
 
 
1476 aa  125  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
241 aa  125  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.44 
 
 
502 aa  124  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2550  ABC transporter related  33.95 
 
 
330 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0766214  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  32.13 
 
 
282 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  24.61 
 
 
640 aa  124  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  37.99 
 
 
1445 aa  123  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2824  ABC transporter related  36.79 
 
 
302 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  26.6 
 
 
1253 aa  123  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  35.65 
 
 
568 aa  122  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  34.88 
 
 
293 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  33.63 
 
 
295 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  35.38 
 
 
283 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  32.13 
 
 
222 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  32.13 
 
 
222 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 
244 aa  121  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  30.12 
 
 
641 aa  121  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  31.2 
 
 
244 aa  121  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  30.6 
 
 
241 aa  121  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  35.19 
 
 
244 aa  121  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  32.57 
 
 
252 aa  120  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  34.4 
 
 
376 aa  120  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  35.48 
 
 
308 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  32.19 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.91 
 
 
411 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  36.84 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  36.24 
 
 
260 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 
241 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.05 
 
 
277 aa  119  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  35.48 
 
 
308 aa  119  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  35.48 
 
 
308 aa  119  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  33.48 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
589 aa  119  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.09 
 
 
367 aa  118  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  36.12 
 
 
1470 aa  118  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  31.16 
 
 
343 aa  118  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  32.69 
 
 
308 aa  118  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.96 
 
 
329 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0370  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.23 
 
 
371 aa  117  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  30.84 
 
 
321 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  34.63 
 
 
379 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4396  ABC transporter related  36.41 
 
 
370 aa  117  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.625138  normal  0.658591 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  31.98 
 
 
384 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  33.33 
 
 
284 aa  117  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
384 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
384 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  35.06 
 
 
1505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  35.68 
 
 
308 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  33.98 
 
 
341 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.1 
 
 
334 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2153  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.26 
 
 
367 aa  117  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.6 
 
 
278 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  34.7 
 
 
381 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  24.43 
 
 
635 aa  116  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  35.85 
 
 
308 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.76 
 
 
278 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  34.56 
 
 
315 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  33.18 
 
 
319 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  36.32 
 
 
277 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>