More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5286 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  56.3 
 
 		 851 aa  938    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  72.03 
 
 		 895 aa  1228    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  100 
 
 		 933 aa  1842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  90.5 
 
 		 849 aa  1164    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  89.22 
 
 		 856 aa  1199    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  55.53 
 
 		 838 aa  883    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  48.12 
 
 		 777 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  52.17 
 
 		 1108 aa  554  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.89 
 
 		 910 aa  479  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  37.05 
 
 		 869 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  37.29 
 
 		 866 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  37.49 
 
 		 866 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  37.29 
 
 		 866 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  36.7 
 
 		 863 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  36.91 
 
 		 861 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.28 
 
 		 851 aa  448  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 848 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  44.55 
 
 		 702 aa  429  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.88 
 
 		 863 aa  317  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.24 
 
 		 1004 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.89 
 
 		 878 aa  308  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  34.08 
 
 		 796 aa  305  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.58 
 
 		 890 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.94 
 
 		 899 aa  299  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.58 
 
 		 802 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.42 
 
 		 799 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.95 
 
 		 903 aa  294  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.1 
 
 		 799 aa  287  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  29.31 
 
 		 770 aa  228  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  28.74 
 
 		 972 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  28.46 
 
 		 590 aa  149  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  31.86 
 
 		 298 aa  128  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  30.38 
 
 		 319 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  25.81 
 
 		 635 aa  124  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.01 
 
 		 568 aa  124  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  31.44 
 
 		 315 aa  124  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  25.99 
 
 		 641 aa  124  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.47 
 
 		 301 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  33.79 
 
 		 329 aa  123  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.03 
 
 		 369 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  27.14 
 
 		 741 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  33.63 
 
 		 311 aa  122  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  36.09 
 
 		 324 aa  121  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  31.52 
 
 		 235 aa  120  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  33.45 
 
 		 322 aa  120  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  36.24 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  33.33 
 
 		 1033 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  33.18 
 
 		 327 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 		 248 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  34.33 
 
 		 588 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  32.91 
 
 		 587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.02 
 
 		 914 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  35.34 
 
 		 237 aa  119  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  33.61 
 
 		 256 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  30.22 
 
 		 322 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  30.6 
 
 		 304 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  33.04 
 
 		 299 aa  118  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  37.9 
 
 		 254 aa  118  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 1171 aa  118  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  33.19 
 
 		 313 aa  118  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  28.87 
 
 		 1253 aa  118  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  32.29 
 
 		 326 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  32.75 
 
 		 320 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  32.75 
 
 		 320 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  31.65 
 
 		 241 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  34.76 
 
 		 453 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  31.44 
 
 		 311 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  31.6 
 
 		 255 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  30.66 
 
 		 317 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  38.1 
 
 		 1090 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  33.64 
 
 		 308 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  30.22 
 
 		 303 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  30.94 
 
 		 241 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  31.25 
 
 		 344 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  32.73 
 
 		 314 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  32.27 
 
 		 308 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  32.29 
 
 		 926 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 		 241 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 		 252 aa  115  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  33.64 
 
 		 322 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 330 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  29.02 
 
 		 310 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  30.63 
 
 		 313 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 		 241 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  34.11 
 
 		 512 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  33.77 
 
 		 322 aa  115  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  30.98 
 
 		 304 aa  115  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  28.87 
 
 		 346 aa  115  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  28.87 
 
 		 346 aa  115  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  32.17 
 
 		 810 aa  114  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  29.33 
 
 		 325 aa  114  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  36.2 
 
 		 284 aa  114  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  33.74 
 
 		 324 aa  115  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  37.56 
 
 		 556 aa  115  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  30.74 
 
 		 248 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 317 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  28.97 
 
 		 346 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  34.47 
 
 		 593 aa  114  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  34.7 
 
 		 307 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  32.34 
 
 		 1271 aa  114  9e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>