More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0947 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  64.19 
 
 		 933 aa  828    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  57.24 
 
 		 856 aa  913    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  78.8 
 
 		 838 aa  1296    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 851 aa  1714    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  56.74 
 
 		 895 aa  916    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  61.97 
 
 		 849 aa  819    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  43.82 
 
 		 777 aa  611  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  53.21 
 
 		 1108 aa  582  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  46.64 
 
 		 910 aa  515  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  37.09 
 
 		 863 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  36.31 
 
 		 861 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  44.94 
 
 		 702 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  34.25 
 
 		 866 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  34.25 
 
 		 866 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  41.03 
 
 		 869 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  34.25 
 
 		 866 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 848 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.87 
 
 		 851 aa  450  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.53 
 
 		 1004 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.86 
 
 		 863 aa  333  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.46 
 
 		 890 aa  333  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  34.39 
 
 		 796 aa  328  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.56 
 
 		 899 aa  325  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.81 
 
 		 878 aa  323  9.000000000000001e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.75 
 
 		 903 aa  318  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.74 
 
 		 802 aa  311  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.61 
 
 		 799 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.06 
 
 		 799 aa  307  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  31.65 
 
 		 770 aa  267  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  37.59 
 
 		 972 aa  175  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  28.65 
 
 		 590 aa  171  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  28.71 
 
 		 741 aa  155  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  25.6 
 
 		 1194 aa  143  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 248 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  27.05 
 
 		 602 aa  136  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  26.84 
 
 		 635 aa  134  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 1171 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  26.19 
 
 		 515 aa  134  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  31.94 
 
 		 298 aa  133  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  36.89 
 
 		 588 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  42.27 
 
 		 324 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 241 aa  132  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 		 241 aa  132  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 		 241 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  29.08 
 
 		 304 aa  131  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  31.37 
 
 		 310 aa  131  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  27.95 
 
 		 1466 aa  130  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0515148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  40.72 
 
 		 324 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  32.57 
 
 		 326 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  26.15 
 
 		 641 aa  130  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  31.38 
 
 		 309 aa  129  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3742  ABC transporter related  34.86 
 
 		 339 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159768 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 241 aa  129  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 		 321 aa  128  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  32.8 
 
 		 256 aa  128  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  31.01 
 
 		 320 aa  128  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  32.35 
 
 		 255 aa  127  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  35.21 
 
 		 329 aa  127  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  25.5 
 
 		 1476 aa  127  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  31.53 
 
 		 326 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  26.78 
 
 		 585 aa  127  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  35.68 
 
 		 312 aa  127  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  31.93 
 
 		 314 aa  127  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.82 
 
 		 319 aa  127  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  30.3 
 
 		 322 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 541 aa  127  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 241 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  31.17 
 
 		 319 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  32.03 
 
 		 327 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  35.07 
 
 		 308 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 		 311 aa  127  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 248 aa  126  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  31.56 
 
 		 241 aa  126  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4550  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.82 
 
 		 314 aa  126  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 255 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  37.33 
 
 		 254 aa  125  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  33.48 
 
 		 315 aa  125  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  32.7 
 
 		 308 aa  125  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  34.78 
 
 		 313 aa  125  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.21 
 
 		 313 aa  125  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  34.43 
 
 		 300 aa  124  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.36 
 
 		 305 aa  124  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  26.22 
 
 		 556 aa  124  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  36.41 
 
 		 321 aa  124  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  32.76 
 
 		 315 aa  124  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  33.45 
 
 		 317 aa  124  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  35.15 
 
 		 325 aa  124  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  34.67 
 
 		 333 aa  124  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  35.61 
 
 		 587 aa  124  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  36.41 
 
 		 321 aa  124  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  39.59 
 
 		 319 aa  124  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  32.26 
 
 		 311 aa  124  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  33.64 
 
 		 322 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 222 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 222 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  30.8 
 
 		 293 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  32.09 
 
 		 328 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  32.73 
 
 		 307 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 331 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>