More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6416 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  100 
 
 		 702 aa  1386    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  49.84 
 
 		 777 aa  528  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  45.32 
 
 		 851 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  46.35 
 
 		 838 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  46.09 
 
 		 1108 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  45.91 
 
 		 933 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  45.21 
 
 		 895 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  43.89 
 
 		 856 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.95 
 
 		 849 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  39.53 
 
 		 866 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  39.04 
 
 		 866 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  39.04 
 
 		 866 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  38.87 
 
 		 863 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  37.77 
 
 		 869 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.07 
 
 		 910 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  38.1 
 
 		 861 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.97 
 
 		 863 aa  304  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  32.15 
 
 		 796 aa  294  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.55 
 
 		 899 aa  281  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.96 
 
 		 890 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.77 
 
 		 903 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.51 
 
 		 1004 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.56 
 
 		 802 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.37 
 
 		 799 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31 
 
 		 878 aa  248  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.31 
 
 		 799 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  48.84 
 
 		 851 aa  240  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  51.8 
 
 		 848 aa  220  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  29.89 
 
 		 972 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  29.6 
 
 		 770 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  29.32 
 
 		 590 aa  164  6e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  39.29 
 
 		 284 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  26.39 
 
 		 1194 aa  132  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  27.95 
 
 		 641 aa  127  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  36.84 
 
 		 308 aa  127  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  25.31 
 
 		 741 aa  126  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.87 
 
 		 322 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.24 
 
 		 305 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  32.16 
 
 		 335 aa  125  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  36.71 
 
 		 588 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.41 
 
 		 308 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  34.52 
 
 		 901 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.69 
 
 		 248 aa  124  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  33.91 
 
 		 340 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.66 
 
 		 308 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 323 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  36.68 
 
 		 309 aa  122  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  34.24 
 
 		 901 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  34.24 
 
 		 901 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  35.24 
 
 		 327 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  34.85 
 
 		 298 aa  122  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  34.35 
 
 		 266 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  25.64 
 
 		 515 aa  121  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.71 
 
 		 305 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  34.35 
 
 		 266 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  35.61 
 
 		 311 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  32.12 
 
 		 1271 aa  120  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  33.74 
 
 		 1463 aa  120  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  34.1 
 
 		 320 aa  120  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  35.59 
 
 		 315 aa  120  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0417  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.11 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  34.22 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  35.78 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 319 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  36.51 
 
 		 301 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  32.93 
 
 		 256 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  35.51 
 
 		 594 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.54 
 
 		 283 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  32.86 
 
 		 587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  36.49 
 
 		 312 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  33.74 
 
 		 1470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  34.35 
 
 		 1106 aa  119  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  33.56 
 
 		 655 aa  118  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  36.73 
 
 		 329 aa  119  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  36.36 
 
 		 322 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 350 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.22 
 
 		 255 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  32.14 
 
 		 322 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.89 
 
 		 343 aa  118  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  35.12 
 
 		 328 aa  118  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  35.51 
 
 		 253 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 		 242 aa  117  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.93 
 
 		 1361 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 282 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.76 
 
 		 363 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  33.91 
 
 		 346 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  34.75 
 
 		 512 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  29.65 
 
 		 541 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 1171 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3803  ABC transporter-related protein  32.31 
 
 		 281 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.76 
 
 		 359 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  36.81 
 
 		 308 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  30.96 
 
 		 301 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  24.22 
 
 		 602 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  33.82 
 
 		 589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  31.03 
 
 		 262 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  34.13 
 
 		 319 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.56 
 
 		 373 aa  117  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  31.03 
 
 		 262 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>