More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3181 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  90.5 
 
 		 933 aa  1162    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  81.9 
 
 		 856 aa  1281    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  63.24 
 
 		 838 aa  814    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  62.26 
 
 		 851 aa  837    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  79.35 
 
 		 895 aa  1068    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  100 
 
 		 849 aa  1694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  44.59 
 
 		 777 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  51.42 
 
 		 1108 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  43.55 
 
 		 910 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  39.91 
 
 		 869 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  40.06 
 
 		 861 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  40.21 
 
 		 866 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  40.21 
 
 		 866 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  40.21 
 
 		 866 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  41.09 
 
 		 863 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.59 
 
 		 851 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 848 aa  416  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  42.54 
 
 		 702 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.83 
 
 		 863 aa  344  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.16 
 
 		 1004 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  35.67 
 
 		 796 aa  321  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.65 
 
 		 899 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.43 
 
 		 799 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.72 
 
 		 890 aa  310  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.17 
 
 		 878 aa  309  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.74 
 
 		 802 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.95 
 
 		 903 aa  303  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.74 
 
 		 799 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  31.07 
 
 		 770 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  29.06 
 
 		 590 aa  155  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  33.33 
 
 		 972 aa  145  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.3 
 
 		 298 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  25.77 
 
 		 1194 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  27.44 
 
 		 741 aa  130  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  28.52 
 
 		 556 aa  127  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  30 
 
 		 319 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.03 
 
 		 369 aa  124  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  25.68 
 
 		 1253 aa  124  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 311 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  33.79 
 
 		 329 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  30.55 
 
 		 327 aa  122  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  33.63 
 
 		 311 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  33.77 
 
 		 235 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.04 
 
 		 301 aa  121  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  33.91 
 
 		 313 aa  121  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 		 248 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  30.04 
 
 		 322 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  31.37 
 
 		 304 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  30.57 
 
 		 315 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  34.09 
 
 		 322 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  27.67 
 
 		 635 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  31.67 
 
 		 344 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  31.65 
 
 		 241 aa  119  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  34.76 
 
 		 307 aa  119  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 241 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  35.34 
 
 		 237 aa  118  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  26.34 
 
 		 641 aa  118  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 		 241 aa  118  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  33.48 
 
 		 453 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  27.92 
 
 		 325 aa  118  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.19 
 
 		 311 aa  118  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  32.29 
 
 		 335 aa  118  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  31.65 
 
 		 314 aa  118  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  32.74 
 
 		 299 aa  117  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  33.62 
 
 		 240 aa  117  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  37.56 
 
 		 1275 aa  117  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  33.47 
 
 		 308 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  32.75 
 
 		 320 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  34.32 
 
 		 1271 aa  117  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 		 241 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  32.75 
 
 		 320 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  32.92 
 
 		 324 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  31.23 
 
 		 308 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.37 
 
 		 568 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  32.58 
 
 		 1033 aa  117  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  34 
 
 		 1171 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  30.74 
 
 		 248 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  32.86 
 
 		 248 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  33.93 
 
 		 318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  36.52 
 
 		 242 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  31.17 
 
 		 255 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  33.93 
 
 		 318 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 		 241 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  35.61 
 
 		 1090 aa  115  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  33.93 
 
 		 318 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  34.9 
 
 		 551 aa  115  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  32.48 
 
 		 317 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  33.93 
 
 		 318 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  29.78 
 
 		 303 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  30.94 
 
 		 310 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  28.96 
 
 		 314 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  34.73 
 
 		 515 aa  115  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 		 241 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  29.97 
 
 		 304 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  31.47 
 
 		 914 aa  115  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  28.14 
 
 		 317 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  32.19 
 
 		 346 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  32.58 
 
 		 346 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  31.86 
 
 		 313 aa  115  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.26 
 
 		 510 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>