More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5595 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  56.89 
 
 
856 aa  904    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  100 
 
 
838 aa  1684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  79.32 
 
 
851 aa  1327    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  56.29 
 
 
895 aa  897    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  63.35 
 
 
933 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  56.39 
 
 
849 aa  879    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  43.01 
 
 
777 aa  614  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  52.1 
 
 
1108 aa  555  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.74 
 
 
910 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  37.43 
 
 
863 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  37.29 
 
 
861 aa  490  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  37.56 
 
 
866 aa  485  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  37.44 
 
 
866 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  37.44 
 
 
866 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.09 
 
 
851 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  41.56 
 
 
869 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  46.35 
 
 
702 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  37.88 
 
 
848 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.61 
 
 
1004 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  34.82 
 
 
796 aa  345  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.28 
 
 
890 aa  343  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.93 
 
 
863 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.36 
 
 
899 aa  335  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.18 
 
 
878 aa  324  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.69 
 
 
799 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.5 
 
 
799 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.49 
 
 
802 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.99 
 
 
903 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  32.11 
 
 
770 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  37.76 
 
 
972 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  27.4 
 
 
590 aa  159  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  27.18 
 
 
641 aa  148  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  28.85 
 
 
741 aa  143  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  26.11 
 
 
635 aa  140  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  27.66 
 
 
602 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  25.46 
 
 
1194 aa  136  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 
248 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.87 
 
 
298 aa  134  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22629  predicted protein  26.92 
 
 
1367 aa  131  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 
241 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  32.57 
 
 
326 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  31.37 
 
 
310 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  41.15 
 
 
324 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3742  ABC transporter related  35.78 
 
 
339 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159768 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  26.54 
 
 
515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  35.24 
 
 
1171 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 
321 aa  129  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  31.37 
 
 
369 aa  129  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  41.67 
 
 
324 aa  129  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  36 
 
 
588 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  32.11 
 
 
326 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 
241 aa  127  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  37.5 
 
 
522 aa  127  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 
241 aa  127  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  31.56 
 
 
241 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  31.4 
 
 
320 aa  127  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  33 
 
 
303 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  30.83 
 
 
327 aa  127  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 
241 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 
309 aa  126  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 
241 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  33.81 
 
 
317 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  32.11 
 
 
304 aa  125  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  34.74 
 
 
329 aa  125  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  31.51 
 
 
314 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 
248 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  36.63 
 
 
254 aa  124  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  30.64 
 
 
322 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  34.86 
 
 
315 aa  124  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  33.97 
 
 
741 aa  124  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  36.1 
 
 
312 aa  124  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  33.8 
 
 
308 aa  124  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.12 
 
 
283 aa  124  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0971989 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  32.56 
 
 
328 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  41.15 
 
 
284 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0738  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.64 
 
 
245 aa  124  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032696  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  38.07 
 
 
1268 aa  123  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  26.93 
 
 
545 aa  123  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08489  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78577]  40.09 
 
 
1425 aa  123  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.63 
 
 
282 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  31.8 
 
 
311 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  36.36 
 
 
322 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  34.65 
 
 
325 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5653  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 
255 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  31.51 
 
 
255 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  25.7 
 
 
1476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  32.16 
 
 
222 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4550  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.62 
 
 
314 aa  122  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  31.85 
 
 
914 aa  122  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  35.29 
 
 
250 aa  122  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  27.96 
 
 
585 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  32.16 
 
 
222 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  31.13 
 
 
256 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  31.88 
 
 
319 aa  122  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.52 
 
 
248 aa  122  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  36.41 
 
 
321 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  33.62 
 
 
313 aa  122  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  30.3 
 
 
319 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  35.39 
 
 
245 aa  122  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  36.41 
 
 
321 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>