More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3609 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  90.15 
 
 		 899 aa  1638    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  59.83 
 
 		 863 aa  1008    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  52.73 
 
 		 878 aa  876    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  100 
 
 		 903 aa  1837    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  37.4 
 
 		 796 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.37 
 
 		 802 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.21 
 
 		 1004 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.91 
 
 		 799 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.57 
 
 		 799 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.68 
 
 		 890 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.53 
 
 		 777 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  39 
 
 		 1108 aa  347  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.88 
 
 		 910 aa  343  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  33.82 
 
 		 851 aa  340  8e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.93 
 
 		 856 aa  323  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.42 
 
 		 851 aa  317  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.47 
 
 		 849 aa  314  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.96 
 
 		 838 aa  311  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  33.38 
 
 		 895 aa  310  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  31.91 
 
 		 869 aa  307  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.39 
 
 		 933 aa  306  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  31.31 
 
 		 861 aa  304  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  31.23 
 
 		 866 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  31.33 
 
 		 866 aa  300  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  31.33 
 
 		 866 aa  300  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  31.29 
 
 		 863 aa  293  7e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  39.56 
 
 		 770 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  33.77 
 
 		 702 aa  274  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 848 aa  229  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  27.69 
 
 		 1194 aa  172  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  27.87 
 
 		 590 aa  161  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  33.33 
 
 		 972 aa  144  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  31.48 
 
 		 328 aa  141  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  25.38 
 
 		 641 aa  137  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  34.38 
 
 		 585 aa  134  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  27.49 
 
 		 1271 aa  130  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  34.73 
 
 		 376 aa  126  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 248 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  25.76 
 
 		 1033 aa  125  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  36.86 
 
 		 1476 aa  125  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 241 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  32.19 
 
 		 248 aa  124  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  25.89 
 
 		 640 aa  124  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  24.27 
 
 		 515 aa  124  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  30.17 
 
 		 241 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  37.91 
 
 		 242 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2824  ABC transporter related  36.79 
 
 		 302 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  31.2 
 
 		 244 aa  122  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2550  ABC transporter related  33.33 
 
 		 330 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0766214  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  34.12 
 
 		 293 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  26.43 
 
 		 1253 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  35.65 
 
 		 244 aa  122  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  35.38 
 
 		 283 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  30.6 
 
 		 241 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  37.12 
 
 		 1445 aa  121  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  30.17 
 
 		 241 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  32.56 
 
 		 282 aa  120  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 241 aa  120  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  32.18 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.11 
 
 		 502 aa  120  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  35.89 
 
 		 568 aa  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  30.6 
 
 		 241 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  35.38 
 
 		 308 aa  119  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  35.38 
 
 		 308 aa  119  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  33.8 
 
 		 295 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 		 343 aa  119  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  35.38 
 
 		 308 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 		 244 aa  118  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 222 aa  118  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 222 aa  118  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  33.98 
 
 		 341 aa  118  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.98 
 
 		 411 aa  118  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  31.53 
 
 		 321 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  33.96 
 
 		 318 aa  117  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  34.86 
 
 		 260 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.54 
 
 		 298 aa  117  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.29 
 
 		 329 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.09 
 
 		 367 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  32.93 
 
 		 384 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 		 384 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  24.07 
 
 		 635 aa  117  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  35.85 
 
 		 379 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  33.93 
 
 		 261 aa  117  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 		 384 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  33.49 
 
 		 244 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4990  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.2 
 
 		 363 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  33.17 
 
 		 308 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  37.02 
 
 		 242 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  31.34 
 
 		 309 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  33.48 
 
 		 262 aa  116  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  31.36 
 
 		 295 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  32.67 
 
 		 589 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  36.62 
 
 		 277 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  31.28 
 
 		 313 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  30.97 
 
 		 266 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  32.17 
 
 		 310 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.11 
 
 		 285 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  35.68 
 
 		 1470 aa  116  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  31.2 
 
 		 377 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  33.77 
 
 		 367 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>