More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0441 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
444 aa  883    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  70.53 
 
 
519 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  50.18 
 
 
776 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.42 
 
 
511 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  45.13 
 
 
349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  44.27 
 
 
530 aa  223  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  42.36 
 
 
618 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.36 
 
 
518 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  42.59 
 
 
622 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  39.55 
 
 
583 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.18 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  39.62 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  41.05 
 
 
557 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  38.66 
 
 
586 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 
661 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  39.8 
 
 
1358 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  40.58 
 
 
574 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  43.7 
 
 
659 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  42.25 
 
 
1108 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  41.92 
 
 
576 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 
585 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  41.92 
 
 
576 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
650 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  41.15 
 
 
484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 
671 aa  190  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  41.04 
 
 
571 aa  190  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 
653 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  41.15 
 
 
695 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  41.34 
 
 
604 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  41.34 
 
 
604 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  39.7 
 
 
566 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  41.34 
 
 
604 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  39.13 
 
 
561 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  32.94 
 
 
664 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  39.93 
 
 
599 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.75 
 
 
438 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 
641 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1113  protein kinase  39.27 
 
 
620 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273994  normal  0.0338435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
569 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  42.47 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  39.65 
 
 
863 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.65 
 
 
916 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1234  serine/threonine protein kinase  42.32 
 
 
539 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  42.59 
 
 
541 aa  183  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.75 
 
 
681 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.14 
 
 
806 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  42.16 
 
 
623 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  38.71 
 
 
587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  38.71 
 
 
587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  36.53 
 
 
626 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  38.71 
 
 
587 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.46 
 
 
880 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  37.41 
 
 
620 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  38.06 
 
 
790 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0497  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
531 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.03 
 
 
664 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.72 
 
 
676 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
503 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
776 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  37.76 
 
 
700 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  39.33 
 
 
589 aa  176  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.08 
 
 
584 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  37.26 
 
 
673 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4009  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.52 
 
 
459 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 
919 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 
623 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  39.5 
 
 
623 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  39.5 
 
 
621 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.31 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  39.53 
 
 
451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.82 
 
 
551 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  38.49 
 
 
480 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3790  serine/threonine protein kinase  38.49 
 
 
487 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1066  protein kinase  40.15 
 
 
486 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  37.55 
 
 
618 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0720  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.73 
 
 
584 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.29 
 
 
607 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.1 
 
 
627 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  35.36 
 
 
597 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.3 
 
 
579 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 
750 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3488  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 
524 aa  170  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.562336  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
430 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
430 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
431 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3400  serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 
522 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 
552 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3463  protein kinase  39.77 
 
 
522 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0363324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3411  protein kinase  39.77 
 
 
522 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  38.19 
 
 
467 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  36.84 
 
 
604 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.02 
 
 
517 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  37.28 
 
 
1032 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  37.79 
 
 
889 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 
628 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  36 
 
 
672 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.38 
 
 
603 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 
468 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.39 
 
 
647 aa  166  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  35.33 
 
 
618 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>