More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2621 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
419 aa  828    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  58.62 
 
 
477 aa  335  7e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1234  serine/threonine protein kinase  52.99 
 
 
539 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  43.24 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 
790 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  48.07 
 
 
587 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  48.07 
 
 
587 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  48.07 
 
 
587 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  49.29 
 
 
430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  49.29 
 
 
430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  49.29 
 
 
431 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  51.3 
 
 
576 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  51.3 
 
 
576 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  48.99 
 
 
621 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  49.66 
 
 
623 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  49.66 
 
 
623 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4009  Serine/threonine protein kinase-related protein  49.65 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3427  protein kinase  47.28 
 
 
450 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  45.77 
 
 
806 aa  253  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11764  anchored-membrane serine/threonine-protein kinase pknF  48.92 
 
 
476 aa  249  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  49.08 
 
 
589 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  43.87 
 
 
451 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  47.65 
 
 
467 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  45.05 
 
 
545 aa  246  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0720  Serine/threonine protein kinase-related protein  44.34 
 
 
584 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  41.01 
 
 
671 aa  222  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  43.12 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  40.72 
 
 
776 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5558  protein kinase  42.96 
 
 
518 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.759172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  45.25 
 
 
622 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  42.39 
 
 
561 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  41.81 
 
 
618 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  41.3 
 
 
574 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  38.35 
 
 
626 aa  196  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12928  transmembrane serine/threonine-protein kinase I pknI  40.71 
 
 
585 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00758832  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  43.18 
 
 
484 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  44.69 
 
 
599 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.66 
 
 
602 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  39.01 
 
 
625 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  39.46 
 
 
439 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  40.99 
 
 
444 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  38.87 
 
 
1053 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  39.8 
 
 
1032 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.38 
 
 
511 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  39.8 
 
 
1032 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  43.7 
 
 
666 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3912  Serine/threonine protein kinase-related protein  47.13 
 
 
574 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  41.07 
 
 
617 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.61 
 
 
863 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.73 
 
 
527 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  43.22 
 
 
571 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
541 aa  189  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  39.12 
 
 
583 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  38.49 
 
 
519 aa  189  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  38.6 
 
 
672 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.93 
 
 
591 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  40.34 
 
 
1358 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.95 
 
 
658 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  43.42 
 
 
659 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 
585 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  41.6 
 
 
1108 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
530 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  38.77 
 
 
1018 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.73 
 
 
1373 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.32 
 
 
627 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4263  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.72 
 
 
315 aa  186  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.99 
 
 
579 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  39.64 
 
 
620 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
618 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  38.93 
 
 
593 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  38.71 
 
 
825 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  38.19 
 
 
468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  37.14 
 
 
618 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  39.25 
 
 
557 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  40.07 
 
 
907 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 
703 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 
746 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.75 
 
 
598 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 
761 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.68 
 
 
664 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  38.71 
 
 
586 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.09 
 
 
499 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.43 
 
 
666 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1066  protein kinase  42.16 
 
 
486 aa  179  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
776 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  34.82 
 
 
563 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  34.2 
 
 
1057 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  39.07 
 
 
537 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  37.98 
 
 
566 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.27 
 
 
647 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.06 
 
 
681 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  36 
 
 
604 aa  177  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  37.68 
 
 
869 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
381 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 
624 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 
624 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 
624 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
468 aa  176  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 
615 aa  176  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.33 
 
 
662 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>