More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4141 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  100 
 
 
312 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  68.08 
 
 
326 aa  397  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  68.08 
 
 
326 aa  397  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  68.08 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5913  diguanylate cyclase  42.76 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  40.56 
 
 
294 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  38.44 
 
 
303 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  36.13 
 
 
316 aa  165  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3350  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  50.27 
 
 
565 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.31 
 
 
772 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  49.38 
 
 
469 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.38 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0150  diguanylate cyclase  42.4 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  45.12 
 
 
278 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.29 
 
 
901 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  48.81 
 
 
498 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  46.24 
 
 
457 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  41.57 
 
 
456 aa  143  4e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  46.78 
 
 
615 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  49.69 
 
 
493 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0655  diguanylate cyclase  42.94 
 
 
172 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000725118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  44.86 
 
 
721 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  47.22 
 
 
580 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1369  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.07 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  39.63 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.35 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  43.18 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.85 
 
 
367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.41 
 
 
301 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  41.41 
 
 
360 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  48 
 
 
493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  46.63 
 
 
866 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.86 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  47.59 
 
 
696 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.09 
 
 
642 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  44.97 
 
 
457 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.37 
 
 
309 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  50.31 
 
 
343 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.67 
 
 
424 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.13 
 
 
505 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3770  PAS:GGDEF  48.28 
 
 
328 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0223226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4666  diguanylate cyclase  47.75 
 
 
501 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0421428  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0569  diguanylate cyclase  43.27 
 
 
403 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  47.7 
 
 
525 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2680  diguanylate cyclase  44.95 
 
 
252 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
298 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  48.02 
 
 
493 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50 
 
 
457 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  41.09 
 
 
425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1303  diguanylate cyclase  43.64 
 
 
237 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  40 
 
 
631 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16500  two-component response regulator  49.7 
 
 
347 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  44.62 
 
 
457 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2089  diguanylate cyclase  41.44 
 
 
306 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  50 
 
 
395 aa  136  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  41.24 
 
 
505 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1513  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.39 
 
 
301 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0153071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4084  diguanylate cyclase  44.05 
 
 
308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  48.85 
 
 
509 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  43.45 
 
 
354 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  41.82 
 
 
775 aa  135  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  45 
 
 
513 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  41.42 
 
 
374 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1305  GGDEF domain protein  48.26 
 
 
502 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.620212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4124  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.5 
 
 
334 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.113929  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.85 
 
 
457 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  43.71 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.7 
 
 
359 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.95 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  42.86 
 
 
1826 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1842  diguanylate cyclase  40.89 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.721538  normal  0.677546 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0680  diguanylate cyclase  45.88 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0139  diguanylate cyclase  42.76 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  46.34 
 
 
227 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0172  GGDEF domain-containing protein  45.03 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  40.21 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.67 
 
 
457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3185  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.36 
 
 
482 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3704  diguanylate cyclase  45.29 
 
 
460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  42.7 
 
 
466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  48.81 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  47.9 
 
 
492 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  43.58 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  48.84 
 
 
464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1357  diguanylate cyclase  44.83 
 
 
508 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1436  two-component response regulator  49.09 
 
 
327 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  43.32 
 
 
457 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  43.1 
 
 
495 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1914  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.51 
 
 
459 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.943888  hitchhiker  0.00021307 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0500  diguanylate cyclase  47.56 
 
 
458 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3733  diguanylate cyclase  43.53 
 
 
625 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1595  response regulator receiver domain-containing protein  42.94 
 
 
234 aa  133  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347977  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  43.18 
 
 
608 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  44.86 
 
 
457 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  42.94 
 
 
625 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.77 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  43.53 
 
 
625 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  45.83 
 
 
668 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  43.79 
 
 
387 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3559  diguanylate cyclase  43.53 
 
 
625 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>