63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1918 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1918  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  297  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.968576  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0223  hypothetical protein  45.24 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0259  forkhead-associated  37.63 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  38.53 
 
 
294 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  41.86 
 
 
302 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2079  forkhead-associated  35.14 
 
 
294 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  42.34 
 
 
295 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  35.92 
 
 
308 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  38.38 
 
 
299 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0694  FHA domain containing protein  35.78 
 
 
290 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  31.07 
 
 
308 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  36.9 
 
 
304 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  38.04 
 
 
306 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  38.04 
 
 
320 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
315 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  34.83 
 
 
310 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 
315 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  33.72 
 
 
304 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  32.69 
 
 
313 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
253 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5356  FHA domain containing protein  34.91 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3496  FHA domain-containing protein  37.65 
 
 
283 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22590  FHA domain-containing protein  46.55 
 
 
152 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.39 
 
 
289 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.65 
 
 
910 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  40.62 
 
 
869 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  43.75 
 
 
863 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2125  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
282 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.473494  normal  0.523626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  31.3 
 
 
245 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  41.82 
 
 
245 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0117  FHA domain-containing protein-like protein  35.62 
 
 
246 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  40.98 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  38.81 
 
 
861 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5252  FHA domain containing protein  32.94 
 
 
255 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.691426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  34.78 
 
 
242 aa  43.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  33.33 
 
 
221 aa  43.9  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  44.07 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  30.48 
 
 
770 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  34.18 
 
 
866 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  41.38 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  32.91 
 
 
866 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0069  FHA domain containing protein  33.82 
 
 
250 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  40.74 
 
 
279 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2844  FHA domain-containing protein  41.38 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  32.91 
 
 
866 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3135  FHA domain-containing protein  41.38 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547801  normal  0.0667215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  34.07 
 
 
1011 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2875  FHA domain-containing protein  41.38 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  41.38 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1259  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 
707 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1302  FHA domain containing protein  36.49 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  31.11 
 
 
241 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  46.3 
 
 
303 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  32.56 
 
 
387 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  37.14 
 
 
238 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  40.91 
 
 
694 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11857  hypothetical protein  35.82 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.751406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0140  FHA domain-containing protein  30.93 
 
 
533 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425814  hitchhiker  0.00649643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1608  FHA domain-containing protein  32.56 
 
 
668 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.861318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0761  FHA domain containing protein  35.62 
 
 
151 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0732  FHA domain containing protein  35.62 
 
 
151 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  32.04 
 
 
848 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4430  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
440 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.206404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>