More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1259 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1259  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 707 aa  1429    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  47.86 
 
 		 740 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  43.71 
 
 		 751 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0021  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  42.8 
 
 		 762 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  41.49 
 
 		 750 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  40.64 
 
 		 757 aa  502  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  40.08 
 
 		 756 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  40.88 
 
 		 751 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  40.88 
 
 		 751 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.29 
 
 		 776 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  37.24 
 
 		 811 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 		 755 aa  323  7e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  39.92 
 
 		 712 aa  323  9.000000000000001e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  36.21 
 
 		 626 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  39.7 
 
 		 741 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  35.98 
 
 		 824 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  39.96 
 
 		 734 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.8 
 
 		 824 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  37.94 
 
 		 779 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  37.94 
 
 		 776 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  39.15 
 
 		 734 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  35.63 
 
 		 763 aa  304  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  37.16 
 
 		 732 aa  304  5.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  36.89 
 
 		 759 aa  301  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  37.34 
 
 		 833 aa  300  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  36.66 
 
 		 739 aa  300  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  36.52 
 
 		 760 aa  299  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  36.42 
 
 		 720 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  37.81 
 
 		 658 aa  294  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  38.92 
 
 		 712 aa  294  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  36.45 
 
 		 626 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.84 
 
 		 625 aa  292  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  36.19 
 
 		 602 aa  292  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 718 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  38.25 
 
 		 735 aa  291  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  38.66 
 
 		 723 aa  291  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  35.5 
 
 		 680 aa  290  7e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  34.39 
 
 		 618 aa  290  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  36.1 
 
 		 720 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  36.93 
 
 		 750 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 		 691 aa  287  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  34.95 
 
 		 759 aa  287  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  34.57 
 
 		 658 aa  286  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  35.94 
 
 		 758 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.03 
 
 		 661 aa  286  9e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  36.51 
 
 		 769 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  35.2 
 
 		 757 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  36.32 
 
 		 757 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.77 
 
 		 648 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  39.02 
 
 		 714 aa  281  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 		 763 aa  279  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 		 730 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  36.47 
 
 		 732 aa  278  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  34.51 
 
 		 742 aa  277  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  35.57 
 
 		 775 aa  276  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  36.43 
 
 		 770 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.69 
 
 		 640 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  31.67 
 
 		 643 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  31.67 
 
 		 643 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  31.63 
 
 		 654 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  34.97 
 
 		 768 aa  270  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  37.74 
 
 		 714 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  36.93 
 
 		 709 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  37.96 
 
 		 750 aa  270  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  35.89 
 
 		 669 aa  270  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  36.43 
 
 		 692 aa  269  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.63 
 
 		 648 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  37.96 
 
 		 796 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  35.43 
 
 		 712 aa  268  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  31.13 
 
 		 683 aa  266  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  38.33 
 
 		 810 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  36.01 
 
 		 728 aa  264  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  31.91 
 
 		 683 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  35.28 
 
 		 728 aa  263  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  36.23 
 
 		 651 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  35.64 
 
 		 727 aa  263  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  32.53 
 
 		 729 aa  262  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.19 
 
 		 643 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  32.09 
 
 		 683 aa  262  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  35.65 
 
 		 727 aa  261  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.64 
 
 		 646 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  34.08 
 
 		 654 aa  260  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  37.2 
 
 		 750 aa  260  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 626 aa  259  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  31.74 
 
 		 683 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  33.14 
 
 		 710 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 686 aa  258  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  31.91 
 
 		 683 aa  258  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 		 678 aa  258  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  34.29 
 
 		 757 aa  257  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  31.74 
 
 		 683 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  35.24 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  33.46 
 
 		 675 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  31.38 
 
 		 683 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  31.74 
 
 		 683 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  32.85 
 
 		 751 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  31.56 
 
 		 683 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  31.56 
 
 		 683 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 		 766 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  34.15 
 
 		 667 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>