More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0798 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
360 aa  727    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  56.8 
 
 
353 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  56.21 
 
 
353 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  50.33 
 
 
357 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  46.31 
 
 
366 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  45.59 
 
 
355 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  45.59 
 
 
355 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  46.82 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  47.68 
 
 
354 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  44.38 
 
 
366 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.03 
 
 
375 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  46.34 
 
 
381 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  46.52 
 
 
353 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  43.43 
 
 
384 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  44.04 
 
 
348 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  47.74 
 
 
339 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  34.66 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  41.28 
 
 
363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  34.23 
 
 
361 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 
340 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
355 aa  136  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  28.66 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
355 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
355 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
355 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  28.34 
 
 
335 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
335 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
335 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  32.89 
 
 
335 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  33.64 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  34.76 
 
 
342 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 
355 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 
357 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  32.03 
 
 
358 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 
357 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  26.13 
 
 
339 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  31.5 
 
 
577 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.25 
 
 
744 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  31.1 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.91 
 
 
658 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.63 
 
 
411 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 
464 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.71 
 
 
656 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.48 
 
 
1089 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.71 
 
 
672 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  27.13 
 
 
701 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 
641 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
515 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  30.85 
 
 
518 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  27.13 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 
575 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  28.86 
 
 
645 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  29.73 
 
 
513 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.25 
 
 
618 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  27.27 
 
 
483 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  25.12 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  29.12 
 
 
675 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.96 
 
 
500 aa  70.5  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 
758 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  26.7 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  25.53 
 
 
701 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.99 
 
 
753 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 
701 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
643 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.42 
 
 
622 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.54 
 
 
575 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  33.54 
 
 
575 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.47 
 
 
618 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.8 
 
 
650 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.69 
 
 
637 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
607 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 
724 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.64 
 
 
758 aa  67  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.56 
 
 
694 aa  66.6  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.01 
 
 
764 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
699 aa  66.6  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  25.84 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  28.37 
 
 
758 aa  66.2  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
713 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.71 
 
 
858 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.52 
 
 
1134 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  32.6 
 
 
641 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  24.77 
 
 
632 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 
665 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  29.3 
 
 
752 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.33 
 
 
465 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  31.64 
 
 
903 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  23.5 
 
 
667 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  28.23 
 
 
518 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  26.18 
 
 
859 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.13 
 
 
723 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  25.82 
 
 
758 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.66 
 
 
662 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 
645 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  30.25 
 
 
969 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.75 
 
 
703 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>