270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0934 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
363 aa  737    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  58.22 
 
 
365 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  45.24 
 
 
361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  36.8 
 
 
360 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  38.24 
 
 
355 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 
353 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.25 
 
 
355 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  37.25 
 
 
355 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  37.33 
 
 
354 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  37.38 
 
 
384 aa  149  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  37.25 
 
 
357 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  35.07 
 
 
353 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 
353 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.64 
 
 
375 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  33.92 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
348 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  37.81 
 
 
342 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  35.44 
 
 
340 aa  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  36.76 
 
 
381 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  32.05 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  35.59 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 
357 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  30.25 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  31.9 
 
 
340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  31.8 
 
 
357 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 
355 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 
355 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 
355 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 
355 aa  126  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
335 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
335 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  30.77 
 
 
335 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  30.93 
 
 
339 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  30.77 
 
 
335 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  27.04 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 
651 aa  72.8  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  25.37 
 
 
636 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.32 
 
 
658 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  26.44 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.37 
 
 
1089 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.16 
 
 
744 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
643 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  26.18 
 
 
681 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.23 
 
 
723 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.13 
 
 
764 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25.27 
 
 
701 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.5 
 
 
656 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  25.4 
 
 
643 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.78 
 
 
758 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  27.42 
 
 
487 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  24.38 
 
 
641 aa  63.2  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.11 
 
 
797 aa  62.8  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  21.94 
 
 
672 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.32 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.51 
 
 
757 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  23.63 
 
 
675 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  24.61 
 
 
699 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.34 
 
 
723 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  26.63 
 
 
758 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
741 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  26.6 
 
 
760 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  23.81 
 
 
702 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  25.27 
 
 
701 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  25.52 
 
 
756 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  26.63 
 
 
758 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.87 
 
 
758 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  23.89 
 
 
752 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  24.86 
 
 
701 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  24.64 
 
 
744 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  27.18 
 
 
515 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.32 
 
 
411 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  26.7 
 
 
518 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.6 
 
 
753 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  28.42 
 
 
641 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  25.93 
 
 
759 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  28.05 
 
 
411 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  22.92 
 
 
725 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  23.91 
 
 
859 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  24.31 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.84 
 
 
701 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  24.6 
 
 
740 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.57 
 
 
652 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 
667 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  29.22 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  27.03 
 
 
518 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  23.5 
 
 
404 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
483 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  24.15 
 
 
400 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.06 
 
 
637 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  23.04 
 
 
665 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  22.27 
 
 
407 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  27.08 
 
 
483 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  27.71 
 
 
553 aa  56.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  22.22 
 
 
410 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  24.47 
 
 
284 aa  56.2  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  24.32 
 
 
712 aa  56.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  26.56 
 
 
483 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25.52 
 
 
858 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>