275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4423 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
381 aa  752    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  80.33 
 
 
366 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  63.22 
 
 
355 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  63.61 
 
 
355 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  63.61 
 
 
355 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  63.2 
 
 
357 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  65.75 
 
 
366 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  53.45 
 
 
384 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  45.65 
 
 
353 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  46.25 
 
 
353 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  48.53 
 
 
353 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  46.39 
 
 
348 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  50.46 
 
 
354 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  47.5 
 
 
360 aa  288  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.38 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  51.48 
 
 
339 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  38.94 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  32.13 
 
 
361 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  32.1 
 
 
365 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
355 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
357 aa  133  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  33.48 
 
 
335 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  33.93 
 
 
335 aa  132  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  32.86 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  33.04 
 
 
358 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
355 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
355 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
355 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  36.27 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  31.7 
 
 
357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.5 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.41 
 
 
658 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.76 
 
 
656 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.86 
 
 
672 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.28 
 
 
622 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  29.57 
 
 
577 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  32.22 
 
 
641 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 
724 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  24.47 
 
 
284 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.92 
 
 
723 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.49 
 
 
753 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  32.47 
 
 
449 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  31.02 
 
 
464 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 
645 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  25.32 
 
 
483 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 
427 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.13 
 
 
678 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  24.68 
 
 
483 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.87 
 
 
723 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
735 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.97 
 
 
744 aa  62.8  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  28.97 
 
 
701 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
632 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.56 
 
 
648 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  28.28 
 
 
701 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 
651 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  30.26 
 
 
725 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  28.77 
 
 
712 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 
320 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  26.84 
 
 
494 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 
320 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  24.74 
 
 
614 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  23.76 
 
 
638 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.3 
 
 
757 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  22.92 
 
 
641 aa  60.1  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  25.75 
 
 
358 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 
1037 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 
468 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  30.09 
 
 
450 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  30.61 
 
 
744 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  25.98 
 
 
665 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  27.34 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  26.26 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0856  adenylate/guanylate cyclase  25.53 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.238934  hitchhiker  0.00191471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.17 
 
 
1014 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.43 
 
 
500 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  25.63 
 
 
760 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 
437 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.71 
 
 
613 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  24.83 
 
 
741 aa  57  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  25.31 
 
 
632 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.42 
 
 
618 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  31.44 
 
 
367 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  27.92 
 
 
572 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 
421 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.49 
 
 
737 aa  56.6  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  28.29 
 
 
364 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  25.81 
 
 
561 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.1 
 
 
1089 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  28.28 
 
 
726 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  26.67 
 
 
607 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  26.84 
 
 
969 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  23.12 
 
 
479 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>