86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1019 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  88.42 
 
 
355 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  91.5 
 
 
355 aa  653    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  88.42 
 
 
355 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
357 aa  741    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  90.99 
 
 
357 aa  651    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  88.42 
 
 
355 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  88.14 
 
 
355 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  88.42 
 
 
355 aa  639    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  89.32 
 
 
339 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  88.73 
 
 
358 aa  614  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  89.82 
 
 
335 aa  614  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  89.52 
 
 
335 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  89.52 
 
 
335 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  89.52 
 
 
335 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  81.85 
 
 
340 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  69.97 
 
 
342 aa  474  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 
357 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 
366 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.16 
 
 
375 aa  155  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  34.53 
 
 
353 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 
355 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 
355 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.25 
 
 
355 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 
384 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  34.98 
 
 
339 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  33.63 
 
 
353 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
348 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
366 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
381 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  31.56 
 
 
354 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
353 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
365 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 
360 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  30.26 
 
 
361 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  33.01 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  27.75 
 
 
340 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.34 
 
 
618 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.56 
 
 
618 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  23.57 
 
 
407 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  21.18 
 
 
459 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  22.17 
 
 
513 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  24.15 
 
 
401 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  23.42 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  24.58 
 
 
367 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  24.64 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  23.96 
 
 
1037 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  23.46 
 
 
488 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  24.75 
 
 
486 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  24.75 
 
 
486 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  24.75 
 
 
486 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  22.97 
 
 
1119 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  22.41 
 
 
607 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  22.58 
 
 
681 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  25.25 
 
 
1156 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.12 
 
 
1160 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  20.77 
 
 
645 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  22.28 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  25.88 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  22.4 
 
 
725 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  20.56 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  20.65 
 
 
699 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.28 
 
 
643 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  20.99 
 
 
665 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  22.83 
 
 
694 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  23.28 
 
 
645 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  24.05 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 
469 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  22.65 
 
 
701 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  24.58 
 
 
729 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  23.2 
 
 
701 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  20.57 
 
 
651 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  22.95 
 
 
488 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  19.66 
 
 
741 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  20.71 
 
 
753 aa  43.9  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  24.31 
 
 
1020 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.38 
 
 
678 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.33 
 
 
723 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  23.75 
 
 
367 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  23.46 
 
 
468 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.47 
 
 
656 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  22.64 
 
 
675 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  22.1 
 
 
421 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  23.81 
 
 
1093 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  23.76 
 
 
308 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.03 
 
 
1089 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>