More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0821 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
361 aa  743    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  45.24 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  40.69 
 
 
365 aa  288  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 
353 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  34.6 
 
 
353 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  33.94 
 
 
355 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  33.94 
 
 
355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  34.23 
 
 
360 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.94 
 
 
355 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  32.13 
 
 
384 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
357 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  37.24 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  34.52 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
366 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  30.57 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  30.4 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  30.7 
 
 
355 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  30.47 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  30.47 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  30.7 
 
 
355 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  30.7 
 
 
355 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  30.7 
 
 
355 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  33.17 
 
 
342 aa  126  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  30.26 
 
 
357 aa  126  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  30.04 
 
 
335 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  33.98 
 
 
340 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
339 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  30.13 
 
 
335 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.96 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  29.82 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  29.39 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.96 
 
 
672 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.96 
 
 
656 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.8 
 
 
764 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  28.88 
 
 
752 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  26.46 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  25.97 
 
 
483 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  25.41 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  27.32 
 
 
651 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  31.06 
 
 
1134 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  24.21 
 
 
641 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 
407 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  26.2 
 
 
760 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.83 
 
 
753 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  26.2 
 
 
759 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 
701 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  26.56 
 
 
643 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.81 
 
 
648 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  24.83 
 
 
756 aa  66.2  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 
410 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.01 
 
 
758 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.95 
 
 
637 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  26.52 
 
 
969 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.79 
 
 
678 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  23.42 
 
 
859 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  24.6 
 
 
577 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  24.6 
 
 
487 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.03 
 
 
701 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  24.61 
 
 
702 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  25.26 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  25.13 
 
 
636 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.67 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  27.81 
 
 
701 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  26.67 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.69 
 
 
1142 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  25 
 
 
518 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  25.13 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.62 
 
 
658 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  27.81 
 
 
701 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.67 
 
 
744 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.14 
 
 
903 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.69 
 
 
1094 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  23.12 
 
 
735 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  26.69 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
284 aa  59.3  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  24.83 
 
 
1105 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  25.52 
 
 
694 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25 
 
 
758 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  25.63 
 
 
575 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  23.91 
 
 
645 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.62 
 
 
657 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  23.28 
 
 
665 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 
515 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  24.48 
 
 
675 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  25 
 
 
518 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  26.72 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  26.71 
 
 
712 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  26.72 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
699 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  22.51 
 
 
643 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  29.69 
 
 
417 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.58 
 
 
1160 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 
586 aa  56.2  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  25.77 
 
 
574 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>